弘治十三年(1500),擢
广东按察佥事,摄
学政。
琼州盗贼
符南蛇叛乱,叛军达四万人,刘大夏时为
总督,命方良永摄
海南兵备,会师讨平叛军。
御史弹劾方良永作战失利。刘大夏已入
兵部,叹息说:“海南之功,当以方佥事为第一,顾坐以罪邪?”为他辩白于朝廷,赏赐银币。改任海北道兵备。
正德三年(1508),父丧
服除,等待任职于
阙下。外官朝见完毕后,必谒
刘瑾。
鸿胪引导方良永诣左顺门叩头完毕后,令东向刘瑾
作揖,方良永拒绝而出,被刘瑾所忌恨。有人劝方良永拜访刘瑾家,方良永厉声说:“官可弃,身可杀,此膝不可屈”,拒绝前往,刘瑾愈加愤怒。等到
吏部任命方良永
河南信阳等处兵备抚民佥事,刘瑾
中旨勒令
致仕。方良永罢官后,刘瑾怒气未消,欲假海南杀人事中伤他。
刑部郎中周敏努力坚持,才得以免罪。
正德八年(1513),擢
广西按察使。揭发
巡按御史朱志荣不法,朱志荣因罪
谪戍。同年冬,升任
山东右
布政使。不久,转任
浙江左布政使。
钱宁以钞二万
鬻于浙江,方良永上疏说:“四方盗甫息,
疮痍未瘳,浙东西雨雹。宁厮养贱流,假
义子名,跻公侯之列。赐予无算,纳贿不赀,乃敢攫民财,戕
邦本。
有司奉行急于
诏旨,
胥吏缘为奸,
椎肤剥髓,
民不堪命。
镇守太监王堂、
刘璟畏宁威,受
役使。臣何敢爱一死,不以闻。乞陛下下宁诏狱,
明正典刑,并治其党,以谢百姓。”钱宁大惧,留疏不下。钱宁谋遣
校尉捕假势鬻钞者,以
自饰于帝,而请以钞直还之民,阴召还前所遣使。钱宁初欲散钞遍天下,先行之浙江、山东,山东为巡抚
赵璜所阻止,而方良永揭发其奸,钱宁从此不敢鬻钞。钱宁方
得志,
公卿、
台谏无敢出一语。方良永以
外僚讼言诛之,闻者
震悚。方良永念及母亲年老,害怕招惹祸端,于是请求
休致。
嘉靖五年(1526),
服除,任
应天巡抚。
杨一清写贺信给方良永说:“江南
巡抚久缺,欲仗名贤以苏
凋瘵”。王阳明也写信给方良永说:“任贤求旧,此意久濶。新命之下,论者谓执事尚须一出”。
方良永侍父疾,
衣不解带三月。母亲生病,方良永年已六十余岁,手进汤药无少怠。方良永居
倚庐哀毁,人称
纯孝。
方良永素与
王守仁友善,而论学与之异。方良永曾对人说:“近世专言
心学,自谓超悟独到,推其说以自附于象山,而上达于
孔子。目贤圣教人次第为小子无用之学,程、朱而下无不受摈,而不知其入于妄。”