顺治七年(1650),同西安
协领根特等率师围攻
太平县,敌军负固抗拒,历经二旬没有攻克,于是挖掘地道,点燃火药炸毁了城池,叛将
李建泰被诛。
顺治十一年(1654),随靖南将军
珠玛喇至
广东,镇压
南明李定国起义军,毕力克图同
护军统领敦拜击溃起义军于
新会,又与
副都统鄂拜、护军统领
赉塔攻打其大营,李定国大败,溺水死者无算。乘胜追至
兴业县,遇到其都督
吴三省、总兵杨成、王三才等率步兵千余拒战,斩杀过半,进抵
横州。李定国渡江远窜,凯旋,叙功晋爵三等
男爵。
顺治十三年(1656),因
员外郎朱世德司榷河西务,亏缺税银,户部错误援引
恩诏赦免,部臣降职、革职,毕力克图罢侍郎任,降世职为二等轻车都尉。
顺治十八年(1661)十一月,清军会师木邦,李定国退至景线(今属云南
保山),白文选退至锡箔江滨,闻清兵至,毁桥而遁。毕力克图与
前锋统领白尔赫图等先至江岸,俘获白文选的间谍,大军结筏渡江。十日后,至旧挽坡,距缅城六十里,缅甸人想要献俘朱由榔,请求大军留驻,以百人进军兰鸠江滨为
扞卫,于是白尔赫图率前锋前往,毕力克图率
护军二百人跟随其后,缅甸人献出朱由榔,于是凯旋返回。白文选被总兵
马宁等追及于猛养,白文选无奈率众投降,毕力克图抚其众,移入边境。
康熙十二年(1673)五月,诏以毕力克图屡从征伐,着有劳绩,加
太子少师。
康熙十四年(1675),授平逆将军,
王辅臣归附
吴三桂,作乱于
平凉,掠夺
陕西郡邑,毕力克图率军驻
大同,
延安、
绥德陷落,又进驻
榆林,侦知贼众三千余屯杨家店渡口,乃分兵三队,乘夜疾进,黎明鸣角渡河,叛军没有料到清军已至,悉惊骇溃窜,遂复
吴堡县城。进师虎耳崖口,遇贼众,复击败之,伪游击黄文英、伪总兵朱龙俱遁,绥德平。,进征延安,贼将李士英等弃城遁,毕力克图令副都统觉和托率兵追击至
宜川,俘斩无算。自驻延安城,招抚附近城邑,保安、安塞、宜川、延长、安定诸县皆复。奉继与扬威将军
阿密达讨
平凉王辅臣,王辅臣驱贼万余迎战,毕力克图督兵合击,阵斩伪总兵郝天祥及贼众无算,距城数里驻营。
康熙十五年(1676),康熙帝派遣大学士
图海为抚远大将军征平凉,命毕力克图率所部前锋赴
宁夏,统辖满洲、蒙古兵防剿。图海至平凉,王辅臣投降。毕力克图还驻平凉。
康熙十七年(1678),移兵守
陇州、
宝鸡,诸路叛军倚仗仰天池高山为巢,毕力克图进兵剿除,招降
灵台、
华亭、
崇信等县,及伪
参将李天秀等三十一员、兵二千余。叛军复据
宝鸡县之蟠龙山,分三队来犯,伪
副将胡长腿据显义关山坡列阵距战,毕力克图以兵两路合击,大败贼众。
康熙十八年(1679),以毕力克图出师日久,年已衰迈,下召还京。图海商议分兵四路取
汉中、
兴安府,令毕力克图同提督
孙思克恢复
略阳。由于已经出征,图海上奏,康熙帝命等汉中、兴安府恢复后撤回。毕力克图先取
成县,招降伪副将王光生等十九员,兵三百六十余名。提督
赵良栋收复略阳,与将军
王进宝收复汉中,图海收复兴安府,于是班师。