首都医科大学附属北京同仁医院（简称同仁医院）始建于1886年，是一所以眼科学、耳鼻咽喉科学为国家重点学科的大型综合三甲医院。同仁医院分为崇文门院区和亦庄院区，现有职工3600余人。医院设有62个临床和医技科室，开放病床1611张，年门急诊量270余万人次。

北京市眼科研究所、北京市耳鼻咽喉科研究所、北京市糖尿病研究所与医院主体并称“一院三所”，成为集医疗、教学、科研、预防、国际交流五位一体的医疗科研联合体。眼科、耳鼻咽喉科为教育部批准的国家临床重点学科，变态反应(鼻过敏)科为原国家卫生和计划生育委员会批准的国家临床重点专科，中医眼科学为国家中医药管理局批准的国家级中医重点学科。首都医科大学北京眼科学院和耳鼻咽喉科学院设在院内。医院设有世界卫生组织防盲合作中心和世界卫生组织防聋合作中心，附设北京同仁眼库(国际眼库协会会员)。

同仁医院现有中国工程院院士1名，北京学者3名，长江学者1名，享受国务院政府特殊津贴专家11名，获国家级、北京市突出贡献专家12名。作为首都医科大学第四临床医学院，医院承担着重要的教学任务。医院现有学位点28个，其中博士学位点13个。硕士生导师114人，博士生导师41人。拥有15个北京市住院医师培训基地。

改革开放以来，医院共获得省部级以上科技成果奖励138项，其中国家级8项，获得国家自然科学基金资助项目253项。

同仁医院历经百余年发展，凝练出“精诚勤和”的医院精神。在新的历史时期，同仁人将继承和发扬百年同仁优良传统，弘扬主流文化，苦练内功，精于内涵，团结一致，创新发展，努力为人民群众提供优质、高效、快捷的医疗服务。

　1.贯彻执行新时期国家卫生与健康工作方针，坚持公益性，保障人民群众健康，推动医院各方面事业健康发展。

　2.遵守国家及北京地区医疗安全、医疗质量和行风建设等相关法律法规，开展法制宣传教育。

3.为人民群众提供优质的医疗、疾病预防控制、健康教育、突发公共卫生事件应急处理等医疗卫生服务。

　4.承担医学学历教育、住院医师和护士规范化培训等毕业后教育、在职医务人员继续医学教育以及基层医务人员培训等医学人才培训教育任务。

　5.承担国家及本市医学科技创新、医学科技研发、医学科技成果转化、药械临床试验等任务。

　6.承担国家及本市医学学科建设、学科人才梯队建设等任务。

　7.开展对外交流和国际合作。

　8.承担国家、本市重大活动医疗保障和突发公共事件医疗救治任务。

　9.承担指导和提升基层医疗卫生机构服务能力的任务。

　10.承担国际、国内对口支援、区域合作等各类政府指令性任务。

　11.建立全面预算管理、成本管控、财务报告和信息公开机制，保障医院资金资产使用安全和效益。

　12.建立医院服务、质量、技术、人才、绩效、药械、物资、后勤、保卫等精细化管理制度措施。

13.承担医院安全生产和维护社会稳定主体责任，做好国家安全和保密等工作。

　14.承担举办主体和上级主管部门交办的其他事项

首都医科大学附属北京同仁医院内设67个临床和医技科室，包括：眼科、耳鼻咽喉头颈外科、儿科、风湿免疫科、妇产科、感染科、骨科、呼吸与危重症医学科、急诊科等55个临床科室；病理科、超声诊断科、放射科、核医学科、检验科等12个医技科室。同时，医院还设有党委办公室、院办公室、人力资源处、纪检办公室、医务处、护理部、门诊部、财务处、保卫处等25个行政职能科室。首都医科大学附属北京同仁医院事业编制3,692人

1886年，清光绪十二年，美国基督教“卫理公会”的兰大夫、卫大夫在崇文门的孝顺胡同开办名为“同仁医院”的眼科诊所。

1899年，“卫理公会”的霍甫金斯·贺庆先生捐资教会在北京东交民巷东口(现北京同仁医院地址)使馆区内选定并购妥院址，开始筹备兴建工程。

1913年，医院在西山选定基地建造楼房，命名为“天然疗养院”，专门治疗结核病。

1914年，医院南楼建成。同年，西病房楼落成。医院的病房设在西楼，分为三层，有眼科、内科和外科病房，眼科约占1/2。

1917年，医院北楼落成，贺庆院长得到了中华博医学会的资助，聘请美国医生潘提司先生来院工作，设立牙科。1918年与协和医院合办牙科专门医学校。

1918年，由于贺庆家族的捐资，新址落成后，英文名称改为“贺约翰氏捐建美以美会医院”。1927年贺庆大夫退职以后，医院英文名称再次更改为“贺氏纪念医院”。

1942年，日伪北京特别市公署卫生局接收同仁医院全部资产，日伪北京市卫生局将同仁医院改为“市立第二医院”，贺庆院长被迫离职。

1945年5月，医院又由日本“开发医疗组合”接管，改名为“开发医院”。

1945年11月14日，卫理公会会督江长川、美国代表白辅德致函北平卫生局，要求将医院收回管理。次年1月，卫理公会收回了医院，恢复使用同仁医院的名称。

1949年4月，在中共北京市委及市总工会的领导下，医院建立了工会。同年11月，建立了新民主主义青年团。

1952年7月，医院与北京市妇婴医院合并，更名为“北京市同仁医院”，增设了妇产科、小儿科。

1953年8月，北京市人民政府正式接管医院，更名为“北京市立同仁医院”。

1955年，医院更名为“北京市同仁医院”。

1958年10月，北京市政府决定将同仁医院的神经外科全部迁到以神经外科为中心的宣武医院。

1959年，眼科研究所成立，设有微生物、病理、生理研究室，罗宗贤教授任所长。

1966年，文化大革命开始后医院更名为“北京市工农兵医院”。

1979年，医院复名“北京市同仁医院”。

1994年，更名为“首都医科大学附属北京同仁医院”。

2024年1月3日，首都医科大学附属北京同仁医院门头沟医院正式签约揭牌。

2024年8月，国家神经系统临床医学研究中心“脑心联盟”单位和“首都医科大学附属北京同仁医院医联体医院”在保定揭牌。

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2022年4月，北京同仁医院团委被授予建团100周年“北京市五四红旗团委”称号。

北京市东城区东交民巷1号、崇文门内大街8号、经济技术开发区西环南路2号。