北京市眼科研究所是国内的眼科研究机构是一所集科研、教学、临床于一体的科研机构。面向社会，致力于改善视觉损害患者的生活质量。

部门设置

研究所设有三大部，即基础部、应用基础部和行政部，共9个科室，即眼微生物、眼生化、眼药理、眼病理、眼生理、防盲办公室、情报室、研发室、行政办公室，各实验室面向社会开放使用。现有科研课题，包括国家自然科学基金课题、863联合攻关课题、北京市自然科学基金、北京市科委课题等，共计34项。