雍正八年（1730），任
广东南雄知府。当地因暴雨发生洪灾，潘思榘督促官吏、兵卒制作木筏，拯救溺水者，并捐出俸禄埋葬死者，赡养生者，活民无数。
乾隆四年（1739），升任
按察使。惩治贪污，处理奸人，受理很多冤狱。有百姓以旱灾纠众入巿掠夺，潘思榘刚刚得病，勉强起床
坐堂，立刻捕捉数十人，处以杖刑，事件得以平定。潘思榘上疏进言：“广东有俍族（
壮族）、
瑶族、黎族三种：俍族世居
茂名，今附
民籍，读书应试如平民。瑶族输税归诚，设瑶童
义学为训课。惟黎族僻处海南，
崖州、
儋州、
万宁、
陵水、昌化、感恩、
定安七州县为最多。生黎居深山，熟黎错居民间相往来，语言相习，请于此七州县视瑶童例设义学，择师教诲，能通文义者许应试。”得到采纳。
乾隆八年（1743），上疏进言：“
常平仓春发秋敛。但收成有迟早，俗所谓
青黄不接。
有司不揆缓急，甫春开粜，
牙行囤积，
吏胥侵渔。民未得实惠，而谷已出逾额，且减价过多。迨秋成买补，非存价观望，冀省耗折；即抑派争买，致昂巿价。请定
浙东诸府以四月、
浙西诸府以六月发粜，价平即止。”乾隆帝认为
因时制宜，得到采纳。又上疏进言：“浙江土狭民稠，全资溪湖容蓄灌溉，乃民间占垦甚多。如
余杭南湖，
会稽鉴湖，
上虞夏盖湖，余姚汝仇湖，
慈溪慈湖，向称巨浸，今已弥望田畴，殊妨水利。嗣后报垦田地，当责有司亲勘，果非官湖，方准
升科；查勘不实，严定处分。”得到采纳。秋，
金华、
衢州、
严州三府发生水灾，旁溢
杭州、
湖州、
绍兴三府，漂流人畜无数。潘思榘负责赈灾。
萧山百姓动荡不安，想要渡江，潘思榘说：“民饥当哺，喧闹则乱民耳。”严加惩治，从此再没有敢于反对的人。潘思榘再次上疏，乾隆帝说：“今年浙江发生洪灾，
浙江巡抚常安有隐瞒灾情之意，汝为其难矣。”
乾隆十二年（1747），上疏请求调济灾区，略言：“凤阳、颍州的百姓民风懒惰懈怠。臣上年遍历查勘，方冬水落，
二麦已播种，而百姓不知
耰锄培壅。所过村落，林木甚稀，蔬圃亦少。臣令有司审察桑麻、蔬菜瓜果，凡可佐小民日食之用者，随宜试种。凤阳、颍州地分三等，冈地最高，湖地稍低，湾地最下。湾地连大河，水发难施人力。湖地则外仰中低，积潦为湖，下流疏泄，即可涸出栽种。冈地水虽不及，而绝少沟池，交秋缺雨，即患又乾。间有傍山麓而为
陂塘，如
寿州安丰塘、
怀远郭陂塘、凤阳六塘，均应及时修筑。与其因灾动用费用过万，何如平时酌动数百金陆续培治。民间减荒歉，多收成，朝廷亦省费用。纵遇偏灾，亦可
以工代赈。凤阳、颍州百姓好转徙，丰年秋成事毕，二麦已种，则携家外出，春熟方归。遇灾留一二人在家领赈，余又潜往邻境。俗谓在家领赈为大粮，在外留养为小粮，沿途资送为行粮，至有一家领三粮者。本业抛荒，人无固志。应令有司严察，
流民过境，实系被灾，方准资送；藉端生事者究惩。”奏入，乾隆帝说：“此乃固本之事，历来无有言及此者。朕甚嘉悦焉！”
乾隆十三年（1748），上疏进言：“福建自乾隆元年至十一年积欠钱粮，正设法清理。民间田业授受，往往不及推粮过割。粮从田出，既有赔粮之户；即有无粮之田，岂可使得业者任其脱漏，无业者代其追比？当饬有司确察，务使粮归於田。”
乾隆十四年（1749），再次上疏进言：“臣清察积欠，一在
屯田户名不清，一在
寺田租赋不一。自
顺治年间裁并
卫所，名虽
军户，实系民耕，乃粮册仍列故军姓名，致难催比，应令覈实更正。寺田始自明季，僧、民相杂，辄称寺废僧逃，藉词逃赋，应令分析寺已废者，官为经理。”乾隆帝命实力为之。再次上疏进言：“
福州城外西湖为
东晋郡守严高所开，周二十余里，蓄水溉田，年久淤垫。臣劝导疏浚，并筑堤建闸。又
福清郎官港、法海埔俱有海滩淤地，臣令筑堤招垦，得地二千一百余亩。”得到乾隆帝的嘉奖。
潘思榘为官专心勤勉，白天会见官属，晚上披阅案牍。旱灾和洪灾必定
抚恤。民风凶狠，推崇
斗讼，多去为盗，侦查得到
主名，命有司捕治。又以
农隙巡行海防，周阅战舰。
朔望入书院与
诸生讲说经艺，习以为常。积劳疾作而不停止。