大中十三年（859年），
唐宣宗挑选驸马，士族子弟都不愿应选。郑颢对于琮道：“你很有才华，只是不拘小节，你愿做
驸马吗？”于琮应诺。郑颢便托付李藩，让他在主持
贡举时将于琮取为
进士。四月，唐宣宗任命于琮为
左拾遗、
内供奉，并将
广德公主下嫁。
咸通十三年（872年），于琮被任命为检校
司空、襄州刺史，充任山南东道节度
观察处置使。当时，
韦保衡恃宠弄权，因于琮对他没有以礼相待，便在皇帝面前谗言中伤。五月，唐懿宗贬于琮为普王傅、分司东都，不久又贬
韶州刺史。广德公主随行前往，一路严加保护，于琮得以保全。
咸通十四年（873年），唐懿宗病逝，
唐僖宗继位，韦保衡获罪被贬。乾符元年（874年），唐僖宗将于琮召回京师，授为太子
少傅。不久，于琮再次出任
山南东道节度使，并加同平章事衔，成为
使相。
乾符六年（879年），黄巢率起义军退入
岭南，围困
广州，并修书给浙东
观察使崔璆、岭南东道节度使
李迢，索要
天平军节度使之职。二人奏报朝廷，却遭拒绝，黄巢便改要广州节度使。于琮时任
左仆射，上奏道：“广州是
市舶宝货聚集之地，怎能交给叛军？”唐懿宗最终授黄巢为率府率。黄巢大怒，率军攻破广州。
广明元年（880年），黄巢进犯
长安，唐僖宗逃往
西川，于琮因患病未能随驾。同年十二月（881年1月），黄巢攻入长安，建立
大齐政权，欲任命于琮为宰相。于琮不肯应命，道：“我病势沉重，命不长久，况且又是皇室驸马，怎能接受叛军官职。”黄巢因此将于琮杀害。
唐宣宗起初欲将
永福公主下嫁于琮。永福公主生性骄纵，与宣宗一同吃饭时，因生气竟将筷子折断。宣宗道：“这种脾气怎能嫁给
士人为妻。”于琮因此改娶广德公主。
黄巢之乱时，于琮遇害。广德公主哭道：“今日我绝不独存，贼军速速杀我。”黄巢不肯，公主便返回房中，自缢而死。
李漼：于琮识沿蓍蔡，文穷典谟，居然国华，蔚为
人瑞。自策名筮仕，淑问益高，伏蒲彰正直之名，起草著经纶之绩。由是道光独立，业擅自强，勇退无俦，谦光有裕。