清华学堂是全国重点文物保护单位，位于北京市海淀区清华园清华大学校园内。

光绪三十年至三十一年间(1904-1905)，美国政府因“所收庚子赔款原属过多”，决定退还部分，徐世昌主张用此款开发东北，袁世凯主张用于实业，而时任清政府外务部右侍郎的梁敦彦则力主开办学堂。梁敦彦的主张恰好与美国政府计划一致。

1908年，梁敦彦代表清政府与美国签约，中国自1909年起每年选派100名留学生赴美学习，直至1940年。根据中美协议，清政府成立了“游美学务处”，梁敦彦还推荐同为第一批留美幼童的唐国安主持赴美留学事宜。1909年清政府成立了游美学务处，负责直接选派学生游美，同时着手筹设游美肄业馆。唐国安参与“庚款留美”的具体组织工作，担任外交部、学部所共属的“游美学务处”会办，进而成为清华学堂副监督、监督，清华学校第一任校长。

1910年，唐国安任外务部考工司主事，1910年11月，游美学务处向外务部、学部提出了改革游美肄业馆办法。唐国安为为游美学务部肄业馆选址清华园，故呈请将游美肄业馆名称改为“清华学堂”。12月，清政府学部批准了这个改革办法。之后，清末兼管学部和外务部的军机大臣那桐于宣统辛亥年（1911年）为清华学堂题写了校名。我们所看到的清华学堂大楼大门外，正额“清华学堂”四字即为那桐手书。

清华学堂大楼分西部、东部两期建成。其西部建于1909～1911年，学校同期兴建的还有二院（在清华学堂以北、电机馆的西边，现已拆除）、三院（在大礼堂以北，现已拆除，在其原址扩建新图书馆）、同方部等一批建筑。

清华学堂于1911年4月29日在清华园开学，这就是清华历史的开端。1912年10月17日，清华学堂更名为清华学校（清华大学前身），唐国安被任命为第一任校长。

唐国安任校长期间，为清华创立时期的经费四处奔走，使清华的办学资金得到了很好的保证，同时抓住时机扩充校园。唐国安一年之内两次扩充校园。第一次在1913年春，请政府将清华园西邻之近春园划拨学校使用，获准；接着，再次请政府将近春园西邻之长春园东南隅划拨学校，获准。这两次扩充共增地480亩。1913年8月22日，唐国安因心脏病去世。

第二任校长周诒春到职后积极筹备改办大学，在任职期间（1913年8月～1918年1月）又盖了一批适应未来大学需要的高标准建筑（清华著名的“四大建筑”——大礼堂、图书馆、科学馆、体育馆均始建于周诒春任内）。

1916年清华学堂大楼向东进行了扩建，扩建后总建筑面积达4560平方米。

由于种种原因，清华国学院于1929年终结。

在20世纪三四十年代，学校的教学、行政等领导机构基本都设在清华学堂大楼里。

解放初期，学堂西部仍是校领导机关（校委会）所在地，东部的一部分曾用作中共清华党总支的办公室。

五十年代以后，梁思成为主任的清华建筑系迁入此楼，清华学堂大楼成为建筑系专用系馆。

“文革”期间，清华学堂大楼因年久失修遭到了严重损坏。

“文革”结束后，关于如何处理这座残旧的建筑，曾存在着不同的意见。在刘达校长的坚持下，由张维副校长亲自向技术室下达修缮加固任务。

1978年底学校基建处许大华等人经丈量重新绘制了、档案馆仅存的清华学堂的建筑图。

在七八十年代，这里曾为精密仪器系工程制图教研组所用，并有全校公用制图教室。

清华学堂大楼是学校研究生院、教务处、科技处、注册中心等机构的办公场所。

1990年代末，清华校教务处迁入东半部，成为全校学生返校注册的必到之处；校研究生部迁入西半部，从此结束了清华学堂用作教室的历史。

2001年，清华学堂作为“清华大学早期建筑”的一部分，进入国务院公布的全国重点文物保护单位名单。

清华学堂在翻修过程中拆除了一楼腐朽的木地板，填平了积水的地下室；为了抗震还用钢材加固了二层楼板和整体结构，外观也被修葺刷新。如今清华学堂建筑面积仅有3600平方米，作为清华园内早期的文物建筑被保留了下来。但是屋面原为红瓦，现为（内侧）灰（外侧）红两色瓦。外部砖石经历多年风化侵蚀，现开裂剥落较多。

上个世纪二十年代，清华学堂曾是培养国学人才的摇篮。1925年，曹云祥校长执掌校政时，清华增设新制大学部和国学研究院。学校特别注意延聘名师，先后聘请了王国维、梁启超、陈寅恪、赵元任等著名学者担任清华国学院的“四大导师”。他们和考古学家李济、文学家吴宓等荟萃于清华学堂，培养学生分别研究中国文、史、哲诸学。国学研究院开设了古史新证（王国维先生）、中国通史（梁启超先生）、方言学（赵元任先生）、人文学（李济先生）等课程，除中国通史在同方部外，其余课程均在清华学堂117号教室讲授。国学院存在的时间虽短，但为我国培养了一代国学专家，其中成就卓著为人们所熟知的有：姚明达、罗根泽、陈守寔、刘盼遂、刘节、陆侃如、谢国桢、王力、高亨、王静如、徐中舒、姜亮夫、戴家祥、蒋天枢、朱芳圃等。

2010年11月13日凌晨1点多，正在修缮的全国重点文物保护单位、清华大学早期标志性建筑清华学堂突然失火。44部消防车、308名消防官兵耗时两个小时才将大火扑灭。大楼东部部分屋顶被烧塌，过火面积达800平方米，火灾未造成人员伤亡。清华大学通报称，大火未对清华学堂主体结构造成影响。

据清华大学校方公布信息显示，此次火灾的过火面积800平方米左右，不对主体结构构成影响。该校负责人称整个清华学堂此次过火面积约3000平方米。

清华学堂从外观看，砖石结构并无太多过火痕迹。但内部呈U字形的建筑整个东半部房顶完全烧毁，仅残存过火木梁和少量屋顶支架。二楼的楼板和楼梯也已燃烧殆尽，整个过火建筑只剩竖立的四壁和部分受损的短墙。

对于校方所称的“火灾不对主体结构构成影响”，市文物局并未表态。