康熙三十九年(1700)十月,调任
吏部尚书,署任总督事。
乌思藏喇嘛擅杀内地
土官,锡勒达上疏请求敕令喇嘛
第巴拘犯解讯,并请移化林营兵驻守
打箭炉,以资弹压,得旨同意。逆番劫掠官兵,阻绝桥道,锡勒达密陈进剿机宜,康熙帝命
侍郎满丕率
荆州驻防官兵和
提督唐希顺相机剿抚。锡勒达上奏请求亲自参加会剿,康熙帝以秦地紧要,需人镇抚,下谕阻止,满丕等取得胜利。起初,锡勒达还未到任陕西时,
四川巡抚于养志和四川提督
岳升龙相互揭发对方,派遣侍郎洛察布泰审问,于养志、岳升龙两人均应革职。命令未下达,岳升龙以于养志交结藏番密奏,康熙帝命锡勒达
覆审,得于养志删改岳升龙
咨报、
文移,不据实上奏,致使逆番侵占内地,
戕害土官,应斩,岳升龙革职。康熙帝以洛察布泰察审未明,贬官。不久,岳升龙恢复原官。
康熙四十一年(1702),
御史王度昭上疏弹劾吏部尚书
李振裕勒取属员礼物,部议李振裕收属员贺寿围屏属实,应革职。锡勒达以吏部尚书衔,管理部事。
康熙四十二年(1703),奉命和
副都统图斯海、徐九如率军前往
荆州,镇压镇筸苗民起事,降三百一寨,剿十五寨。锡勒达与荆州副都统
珠满、湖广提督
俞益谟剿灭天星寨、龙椒洞、排六梁等三寨。乱定,与
总督于成龙、
巡抚赵申乔议立营汛,增设镇筸道、
乾州同知、凤凰营
通判。