科布多参赞大臣是清代蒙古科布多地方的驻扎大臣。乾隆二十六年（1761年）置，驻科布多城（今蒙古国科布多省省会）。宣统三年（1911年）外蒙古独立，1912年库伦哲布尊丹巴博克多汗国政权攻陷科布多城，末任参赞大臣被逐。

清代初年，科布多一带为蒙古喀尔喀部牧地，后为准噶尔占据。乾隆年间平定准噶尔，漠西蒙古各部陆续归附。大清乾隆二十六年 (1 76 1 ) ，清朝在彻底平定准噶尔部后 ，鉴于阿尔泰山地理位置的重要性 ,遂在该山东麓科布多城设立参赞大臣 ，以扎拉丰阿为首任参赞大臣，驻扎于杜尔伯特部境内的科布多城，科布多参赞大臣为藩部驻扎大臣，负责“佐画机宜”，其下置科布多领队大臣一人，隶于乌里雅苏台将军，管辖以阿尔泰山为中心的蒙古高原西部及准噶尔盆地北端的额尔齐斯河流域 ，直至斋桑泊的近 4 0万平方千米的广大地区，统率守城马步兵、卡伦士兵、种地蒙古兵、牧场兵以及向导兵等总计2，000余名，管辖赛音济雅哈图盟各部兵马，以及扎哈沁1旗又1佐领，明阿特1旗，阿尔泰及阿尔泰诺尔乌梁海9旗的兵马。

嘉庆以后，科布多参赞大臣辖八部三十二旗：

杜尔伯特部十六旗（姓绰罗斯。本游牧于额尔齐斯。乾隆十八年置。）

杜尔伯特部左翼十一旗：特固斯库鲁克达赖汗旗、中旗、中左旗、中前旗、中后旗、中上旗、中下旗、中前左旗、中前右旗、中后左旗、中后右旗

杜尔伯特部右翼三旗：前旗、前右旗、中右旗

辉特二旗：下前旗、下后旗

明阿特部一旗（旧属乌梁海，后属札萨克图汗部中左翼左旗。乾隆三十年改属科布多。）

扎哈沁部二旗（旧属准噶尔，乾隆十九年置，嘉庆五年增置一旗。）

科布多额鲁特部一旗（旧属达木拜台吉。）

阿尔泰乌梁海七旗

阿尔泰乌梁海左翼四旗：副都统旗一、散秩大臣旗一、总管旗二

阿尔泰乌梁海右翼三旗：散秩大臣旗一、总管旗二

阿尔泰诺尔乌梁海二旗

新土尔扈特部二旗（旧属准噶尔，乾隆三十六年置。）：新土尔扈特左旗、新土尔扈特右旗

新和硕特部一旗（原属新土尔扈特部，嘉庆元年分置。）

至同治三年 (1 86 4) ，科布多参赞大臣辖地四至 ：东临奇勒稽思泊 (今吉尔吉斯湖 )、扎布噶河、喀拉泊(今哈腊湖 )与同属乌里雅苏台治下的札萨克图汗部相接 ；南、西南以拜山、哈布山 (今北塔山 )、乌伦古河、额尔齐斯河、斋桑泊 ,直至铿格尔图喇 (今哈萨克斯坦乌斯季卡缅诺哥尔斯)。

同治七年（1868年），置布伦托海办事大臣、帮办大臣各一员，辖阿尔泰山南路布伦托海（今乌伦古湖）一带，驻地在今新疆福海县。

同治八年（1869）省布伦托海办事大臣，布伦托海仍隶科布多参赞大臣。

光绪三十二年十二月（1907年1月），置阿尔泰办事大臣，辖阿尔泰乌梁海诸旗、新土尔扈特部、新和硕特部及哈萨克斯坦流民，驻承化寺。

宣统三年（1911年）武昌起义发生后，库伦的八世哲布尊丹巴呼图克图宣布外蒙古独立，并派兵西进乌里雅苏台和科布多。蒙古各旗札萨克未加抵抗，只有科布多的杜尔伯特汗噶勒章那木济勒效忠清朝，仍听科布多参赞大臣节制。

1912年，丹毕坚赞、马格萨尔扎夫等率军攻占科布多城，驱逐了末任科布多参赞大臣溥钅闰及驻防清军，科布多全境陷落。

历任科布多參贊大臣

历任科布多办事大臣

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