道光二十六年，出为云南临安知府，总督
林则徐曾与共事河工，知其才，密荐可大用，调署永昌。边夷滋扰，亮基用土弁左大雄擒匪首，事乃定。超擢云南按察使，就迁
布政使。
咸丰二年，调
湖南巡抚，在途闻贼围长沙，疏请驻守
常德。诏趣进解省城之围，至则梯城而入，屡出队与城外援军夹击，贼解围去。破
岳州，入湖北，
汉阳、
武昌相继陷，
湖广总督徐广缙以罪罢，命亮基代之，规进剿。亮基疏言宜防贼回窜，意在专顾湖南，诏趣速进。
咸丰三年春，贼弃武汉东下，亮基抵湖北筹办收复抚恤事宜。
通城、
崇阳、
嘉鱼、广济土匪起，平之。贼自下游分窜江西，亮基督师扼道士洑、
黄石港，分兵赴援。秋，贼之分窜河南者，由
罗山入湖北
黄安、
麻城境，水陆夹击，歼之。
调
山东巡抚，未行，江西贼由
九江来犯，令道员
徐丰玉御之於田家镇，战失利，丰玉阵亡，亮基坐降四级留任。时粤匪
李开芳等犯畿辅，踞静海。亮基至山东，奉命扼
德州，防其南逸。南路贼欲由淮、徐窥伺北犯为应援，令
按察使厉恩官率兵驻
宿迁之北以防之。
咸丰四年，贼入山东境，亮基驰扼
济宁，杜其北窜。寻陷
郓城，扰
范县、
寿张、
东平，绕出贼前截击，败之於
临清黑家庄。既奏捷，帮办军务大臣胜保劾其取巧冒功，诏斥亮基欺罔，并追论初赴湖南不急趋长沙，及去湖北时但求自全，居心狡诈，褫职，遣戍
军台。逾年，
给事中毛鸿宾言临清之役，胜保妄劾，御史
宗稷辰亦言亮基能任事，未尽其用，乃释回，发东河差遣，寻命往安徽随办军务。
咸丰七年，予五品
顶戴，命赴云南帮办剿匪事宜。云南回匪方炽，
团练横行省会，总督
吴振棫初至，驻
曲靖，裁抑练勇，招抚回众。
沾益回最悍，集众犯
宣威，亮基督按察使
徐之铭等率兵击走之。咸丰八年春，又败之於袁家屯，歼贼甚众，馀党就抚，诏嘉之，授云南巡抚。既而振棫乞罢，擢云贵总督，亮基荐徐之铭代为巡抚。
临安回匪攻城，扰及阿迷，剿平之。九年，省回就抚后，踞碧鸡关，劫夺近郊，分剿乃散。又剿平彝、安宁、
缅宁、楚雄诸匪，
武定、
罗次、富民、
禄丰、
禄劝诸州县先后克复。然回、练互相猜忌，乱机时起。
徐之铭既为巡抚，贪纵险狠，与亮基阴不相能，时构煽其间。咸丰十年秋，回人
掌教马德新、徐元吉，武生马现，率各属
回民来省乞抚，住城外江右馆，亮基约之铭同诣抚谕。之铭阴嗾已散
练丁拥至督署阻挠，谕之不可，杀通海知县雷焱於门，遂逼杀招抚委员绅士马椿龄、孙钧。亮基为所胁持，不敢入告，以病乞罢，命
刘源灝代之。源灝久不至，亮基迳去。
咸丰十一年，至湖北，乃疏陈滇事，劾之铭不法。会布政使邓尔恒升任
陕西巡抚，去滇，之铭嗾匪戕於路。於是罢源灝，以
潘铎署总督，命亮基赴滇查办，督师剿匪。亮基疏请发部照募捐充饷，募勇千人然后行，与潘铎先后至四川，欲资其饷力、兵力。四川兵事未定，无以济之。林自清者，亮基之旧部，方署云南提督，与之铭及
马如龙等皆不协，回人仇之。闻亮基在四川，擅率所部号万人入川求效用，阻之不听。诏亮基抚谕解散，
而之铭嗾马如龙等声言拒亮基不使入境，相持久之。
同治元年，潘铎先抵任，请暂留之铭以毕抚局，遂
改命亮基以总督衔署贵州巡抚。未几，之铭复阴嗾回众为变，铎被戕，而云南之乱愈亟矣。
同治二年，亮基至贵州，黄号、白号、苗、教诸匪并炽，上下游遍地皆贼。亮基令总兵
沈宏富等攻
遵义螺蛳堰，破之，歼馀匪於上稽场。令总兵刘义方等剿
思南教匪，复普安、安南，又连破苗匪於
桐梓鼎城及水城厅马龙胯，擒匪首何润科
等於黔西，降万人。
同治三年，尚
大坪匪犯省城，督沈宏富等战於郊，歼贼千计，复修文。总兵林自清、
赵德昌克
龙里，又复
兴义，解
清镇之围，收复定番、广顺、长寨
诸城，破龙泉、
湄潭黄、白号匪老巢，克滇西卫城。
同治四年，克黔西
石阡、
永宁、
荔波，贵州地瘠财匮，饥军索饷，时虞哗噪。亮基抚驭防剿，仅得粗安，而所部诸将多骄蹇，舆论不协，为
侍读学士景其濬论劾。亮基乃劾总兵林自清、刘有勋，副将池有连等劫掠扣饷，不听调度，请严治。诏布政使
严树森察奏，亮基复具疏自陈，言树森规避贵州，安坐邻省不亲至，於是亮基、树森并褫职。