食品微生物（food microorganisms） 是与食品有关的微生物的总称。包括生产型食品微生物（
醋酸杆菌，
酵母菌等）和使
食物变质（
霉菌，细菌等）和食源性病原微生物（
大肠杆菌，
肉毒杆菌等）。食品微生物与人类关系紧密，对食品微生物的了解、利用、和防治在很早以前就有很大的进展了。
与食品有关的微生物。研究食品微生物的性状及其与食品相互关系的科学称为
食品微生物学。它是一门由医学、农业、工业的微生物学中与食品生产有关的部分相互融合而成的一门学科。食品微生物包括 3大类。①:通过它的作用,可生产出各种饮料、酒、醋、酱油、
味精、
馒头和面包等
发酵食品。②：是引起食品变质败坏的微生物。③：又称食源性病原微生物。包括能引起人们食物中毒和使人、动植物感染而发生传染病的病原微生物。
人类对食品微生物的利用,起源很早。远在公元前16～前11世纪，中国就会利用微生物
酿酒。古书曾记载有：“
仪狄作酒，禹饮而甘之”。《商书》中也记载有：“若作酒醴，尔维曲；若作禾羹，尔维盐媒”。“曲”是用谷物培养
霉菌等微生物制成，“”是发芽的谷物，如作啤酒的麦芽，“媒”是含有
乳酸菌之类的菜卤。当时人们还不知道这是微生物的存在和作用。直到16世纪,荷兰人A.van
列文虎克首次制成了放大200～300倍的显微镜后，才看到微生物。1857年，微生物学家L.巴斯德证实
酒精的
发酵过程由
酵母引起，并经长期研究，奠定了微生物学的基础，解决了当时法国由于酒的变质给酿造业带来的重大损失问题，开创了
巴斯德灭菌法（现称
巴氏灭菌法）。这种灭菌方法至今仍应用于酒、醋、酱油、牛奶、果汁等食品的灭菌。20世纪以来，由于
电子显微镜的发明，生物化学和
化学分析技术等学科的发展，促进了微生物学从细胞水平、
亚细胞水平进入分子水平。尤其是70年代遗传工程科学的发展，有力地推动了食品微生物学的发展。通过诱变、
细胞融合等技术，选育出高产的
发酵食品微生物优良菌株，可提高产量，改变食品工业的面貌。
食品微生物无特殊的分类系统。按照
微生物分类系统，可将与食品密切相关的微生物分为细菌、 酵母菌、
霉菌和病毒。由于微生物种类繁多，很多微生物的亲缘关系（根据生物的外部性状、内部结构、生活特性等加以确定）尚未清楚，所以尚不能完全按照亲缘关系进行分类。细菌有3种不同分类系统,即克拉西里尼科夫氏、伯杰氏和普雷沃氏分类系统。他们的通用分类单位命名法则和高等动植物一样，依次分为界、门、纲、目、科、属、种。种是分类的最基本单位。从某地区或某实验室分离到的菌种，称为菌株或品系。酵母菌为真菌的一部分，采用
荷兰人洛德1952年发表的
酵母分类系统分类。霉菌也为真菌的一部分，不同的真菌分类学者采用不同的
霉菌分类系统，但在“纲”这一级分类意见都一致。
世界各国都采用
双名制的国际
植物命名法命名微生物。命名后的名称为学名。它由两个拉丁文组成，前一个是属名，词首字母大写；后一个是种名，字母则一律小写。如Staphylococcus aureus,前一个词是
葡萄球菌属，后一个词是金黄色的意思，中
译名叫
金黄色葡萄球菌。有的还在学名后附上命名人和发表年份。当分离到未知菌名时，即根据其形态、生理生化生态以及
免疫血清反应等特性，对照各分类系统进行鉴定确认为某一菌种名。
指将微生物
接种到培养基内，经一定条件使微生物生长繁殖。接种的方法有 6种。①涂布法：将纯菌或含菌材料均匀地涂布在
固体培养基表面。②划线法：用
接种环沾取含菌材料，在固体培养基表面划线。③
倾注法：取少许含菌材料放入无菌
培养皿中，然后倾入已融化并已冷却至48℃左右的
琼脂灭菌培养基，摇匀后冷却凝固。④点植法：用
接种针在固体培养基表面接触几点。⑤穿刺法：用接种针沾取的微生物经穿刺而进入半固体深层培养基中。⑥
浸洗法：用接种针
挑取含菌材料，在
液体培养基中洗下。培养方法则根据微生物对氧的要求情况分为需氧和
厌氧两种。需氧培养是指必须在有氧环境中进行培养，必要时用振荡或通气搅拌达到充分供氧；
厌氧培养是培养过程一直保持在少氧或无氧的环境中。厌氧的方法可用物理、化学、生物等办法使培养容器内的氧气部分或全部消除。通常用抽真空方法，有时将两种方法结合使用，使厌氧培养更为理想。
接种、培养是食品微生物应用、研究过程中最基本和必不可少的方法。
《食品微生物》是一部关于食品微生物基本理论及在食品行业应用的实用技能型教材，简单介绍了食品微生物的发展历史和研究内容，详述了食品微生物的形态、培养、
遗传变异以及在食品加工、保藏等领域的应用。主要包括食品微生物的形态、微生物的培养、微生物菌种的选育和保藏、微生物与食品变质、微生物与
食品保藏、微生物在食品发酵工业中的应用、微生物检验与食品安全控制、
微生物学实验等内容。
吴坤，女，1944年11月出生于哈尔滨市，中共党员，现为
哈尔滨医科大学公共卫生学院营养与食品卫生学研究室主任，教授，
国家重点学科的学科带头人，国家精品课程负责人，博士研究生导师及博士后指导教师，国务院特殊津贴获得者。曾作为访问学者去
澳大利亚悉尼大学和高级访问学者去美国德洲大学深造。主要学术兼职：
国务院学位委员会学科评议组成员、
中国环境诱变剂学会常务理事、
中国毒理学会食品毒理专业委员会常务理事、
中国营养学会微量元素专业委员会常务委员、中国食品法典专家委员会委员、
中国食品科学技术学会营养支持专业委员会常务理事、国家自然科学基金委员会第九、十届生命科学部专家评审组成员、
中华医学科技奖和中华医学青年奖评审委员会委员、教育部高等学校食品与营养科学教学指导委员会委员、全国成人高等医学教育教材评审委员会委员、黑龙江省营养学会副理事长兼秘书长、《
癌变·畸变·突变》常务编委、《
疾病控制杂志》及《
卫生毒理学杂志》编委等。