甲子士祸（갑자사화）是指1504年（按干支纪年为甲子年）朝鲜国王燕山君为了给生母废妃尹氏复仇而对勋旧派和士林派同时展开清洗的历史事件。

朝鲜国王燕山君的生母废妃尹氏在成宗年间因妒忌而被废，最后被赐死。燕山君当时还年幼，由贞显王后抚养成人。据说他曾得到母亲的带血手帕，为之哭泣，但并不知道母亲被赐死的内幕。燕山君一起想起用外戚任士洪，戊午士祸前因为有台谏牵制而无法实现。1504年春，燕山君以特旨的形式起用成宗时被禁锢的任士洪，并封他为君。与此同时，礼曹判书李世佐因在养老宴上倒御御酒时不慎将酒洒在燕山君的衣服上，被视为不敬；京畿道观察使洪贵达因燕山君拣择世子嫔时以孙女有病为由不让她入宫，也被视为不敬，两人遂被罢官流放，此时任士洪告诉燕山君，李世佐就是当年给废妃尹氏带去死药的承旨，于是李世佐被赐死，甲子士祸也由此展开。

燕山君早就对勋旧派的“凌上之风”极其不满，便借为母报仇之机掀起大狱，将废妃过程中参与讨论的所有大臣全部处死。1504年三月以后，除了李世佐外，尹弼商、李克均、成俊、权柱、李胄等十余人被杀。已死的韩致亨、韩明浍、郑昌孙、鱼世谦、沈浍、李坡等被剖棺斩尸。宫中则有成宗宠姬郑、严二贵人和她们的儿子安阳君、凤安君遇害，仁粹大妃被气得一病不起而死。燕山君还追尊母亲为齐献王后并升祔宗庙，受到弘文馆应教权达手和李荇的反对，燕山君处死权达手，流放李荇。在此期间因各种小事或谏言忤逆燕山君而被处死或流放的人也为数不少。到了九月，更连同之前戊午士祸被流放的士林派中生存者金宏弼、崔溥等也全部处死，已死者剖棺斩尸，甲子士祸至此告一段落。

之前朝鲜王朝君臣三角关系是王权、大臣（宰相）权、言官（台谏）权相互制衡，戊午士祸打击了言官权，甲子士祸打击了大臣权，制约王权由此缺失，燕山君的暴政变本加厉，更加纵情声色，两年后就发生中宗反正，推翻了他的统治。