清末，
维新变法运动日趋高涨。
维新派在教育方面提出了“改革科举，兴办学堂”的主张，得到了
光绪皇帝的
赞同。
光绪于二十四年（1898年）下诏改书院为学堂。光绪二十七年（1901年），严州知府留宗标商请双峰书院院长王韧，将府立双峰书院改为六睦学堂（意为
睦州六县之学堂），王韧为堂长，立石碑《修改六睦学堂记》。六睦学堂的创建标志现代新学之始，这就是本校的诞生。
2005年，严州中学教育集团正式成立，拥有严州中学梅城校区、
严州中学新校区、
新世纪实验学校三所成员学校。
新安江校区现有高中班级42个，学生2300多人，教职工170多人，专任教师150多名。其中省特级教师2名，
正高级教师2名，高级教师49名。
梅城校区拥有勤奋敬业的师资队伍。现有教职工139人，专任教师123名，其中中高级职称者80人，有市级以上学科带头人和市级
教坛新秀37人，并拥有一大批青年骨干教师。
严州中学新安江校区是
浙江省一级重点中学，被上级有关单位命名为浙江省
文明单位、浙江省现代教育技术实验学校、浙江省治安安全先进单位、浙江省卫生先进单位、
杭州市模范集体、杭州市安全文明示范校园、浙江省
绿色学校、杭州市学生工作先进集体、杭州市保护明天行动先进集体。学校先后荣获浙江省文明单位、浙江省绿色学校、省现代教育技术实验学校、省科研兴校200强学校、杭州市先进基层党组织、杭州市模范集体、杭州市文明学校、杭州市厂（事）务公开先进单位、杭州市平安示范校园、杭州市先进
基层团委、杭州市示范基层党校、杭州市
心理辅导优秀站、杭州市“保卫明天行动”先进单位等
荣誉称号，成为
中国教育学会中学语文专业
教学委员会“十五”重点课题“创新写作教学研究与实验”基地学校、
国家基础教育实验中心外语教育研究中心实验学校。
2008年，根据浙江省精神文明建设委员会下发的浙江省文明单位的复评结果，继续保留“浙江省
省级文明单位”的荣誉称号。