旗本（はたもと；Hatamoto）按语意指战场上主将旗下的近卫武士。到江户时代，专指将军直属武士中领地不满一万石，但有面见将军资格者。其领地多少不一。3000石以上者设阵屋，由自己管理。3000石以下者多委诸代官管理而收取年贡。可担任幕吏，也可拥有陪臣。少数旗本受特殊优遇，可如同大名实行参觐交代，称交代寄合。1817年(文化十四年)旗本4800余人。19世纪50年代达5280余人。加上旗本陪臣和御家人，号称“旗本八万骑”，是幕府的主要军事力量。

战国时代大名除了使用他的家臣指挥他的军队外，一些大名会安排由他直接指挥的军队（概念与侍卫相似）。例如上杉家的旗本千坂景亲在每一次上杉谦信出征的时候，他也会在本阵留守。并取得良好的战绩。

旗本的定义就是1万石以下，而且是将军的直臣，都当作旗本，当中喜连川氏是例外，虽然他们只领有五千石，但德川幕府当作为大名。通常旗本由一些失格的大名（例：最上、福岛）以及一些大名家的末子组成。一些收入较高的旗本，平时的工作为负责江户城的护卫。收入较少的旗本会被编入小普请的工作。

江户时代对于旗本的俗称为“旗本八万骑”，根据1722年调查数目为5000。共100名为拥有5000石以上的石高，300名拥有3000石以上，当中九成的旗本只有500石以下。 旗本又分为：铁炮众, 马回, 小姓, 弓众, 黑母衣众, 赤母衣众

旗本侧近向来为大名所倚重，因为他们是大名政治体系中的新鲜血液，适当的注入可以有效的提高大名政体运作的向心力。以室町幕府最强将军之称的足利义满为例，其大力招募那些武士世家的没有继承权的武士，给予他们近卫军和贴身秘书的权力。一旦看哪家大名不顺眼，马上就有了理由随时可以介入其中。重用这些无根基的旗本，他们只会更依赖于大名，所以织田信长能那么成功，跟他注重培养旗本侧近有关。织田信长利用阿犬前田利家强力介入前田家家督统继，这些事件变相的提高了家督威望跟对麾下豪族的控制力，这在“下克上”风暴的战国时期是非常重要的。