尹源，初字子渊，更字子渐。议论文章，
博学强记，皆有以过人，与弟尹洙皆以文学知名。曾与其弟尹洙一同跟从
穆修学习古文，并受穆修传授《春秋》。尹源最初以祖荫补三班借职，其后迁左班殿直。天圣八年进士及第，初授奉礼郎，累迁太常博士。历知芮城、河阳二县，签署孟州判官事，又知新郑县，后通判泾州、庆州。
庆历二年，李元昊声言入寇，围定川寨，大将
葛怀敏发泾原兵救之。尹源给葛怀敏写信说：“贼举国而来，其利不在城堡，而兵法有不得不救者，并且我军畏法，看见敌军一定会赶去，并不计较利害，这就是数次战败的原因。应当在瓦亭驻兵，见利而后动。”葛怀敏没有听从尹源之言，战败而亡。
当时，仁宗任用范仲淹、富弼、韩琦，欲更置天下事，但权幸小人不便，三人皆罢去，而尹洙与一时贤士大多被诬枉得罪。尹源忧悲发愤，认为生可厌而死可乐。苏舜钦因进奏院案得罪，尹源数次与他往来，一同剧饮，作薤露长歌，举音凄断，又有厌苦世故之说。
尹源担任泾州通判时，知沧州
刘涣因私自杀部卒而被贬为
密州知州。尹源上书陈情说：“刘涣是主将，部卒有罪不肯受罚，鞭打他就大叫万岁，刘涣斩他并不过分。因这事而贬刘涣的官，为臣恐怕边塞的士卒会更加骄纵，轻视主将，这种影响实在不小。”刘涣于是得到赦免。