东道海子南端处于古尔班通古特沙漠的南部边缘，向北已经深入沙漠，发育在
纵向沙垄之间，是北沙窝独特的地理结构形成的沙漠洼地。
东道海子的水是由天山雪水随
乌鲁木齐河流入
猛进水库、
青格达湖水库、
八一水库、天然降雨以及上游农牧业灌溉的剩余水进入北沙窝汇集而形成，并与西侧的白家海子、郑家海子等5个小湖连成一片，水域面积约2000hm2。
东道海子是新疆特有的典型荒漠湿地。周边动植物资源丰富，据有关统计资料，东道海子以水鸟和
有蹄类动物居多，主要动物有
北山羊、
鹅喉羚、
野猪、
野兔、
石貂、
兔狲、
金雕、
猎隼等58种；湖区栖息的鸟类有
野鸭，
赤麻鸭、
黄鸭、
天鹅、大雁等30余种；鱼类有
鲤、
黑鲫、
白鲢等约10种；昆虫有100余种；湖泊周围植物有
芦苇、
柽柳、
梭梭、
胡杨、
水葱、
芨芨草、
香蒲和
黑三棱等100余种。
20世纪90年代，东道海子受到的主要人为活动影响是放牧和采樵对
荒漠植被破坏和农业排碱；管理部门重点关注的是荒漠植被的保护的生物多样性保护。但近年来，在新疆跨越式发展的大背景下，上游城市经济发展迅速，工业园区如
雨后春笋般接连上马，企业入驻较快而园区污水处理设施建立滞后的现象较为普遍，企业污水直排或超标排放的情况也屡见不鲜。而东道海子地理位置特殊，处于乌鲁木齐米东区、
五家渠、
昌吉的交接地带，地势低洼，上游乌鲁木齐甘泉堡工业园区、
米东新区化工工业园区、五家渠102团工业园区的污水大都是随102团工业区泄洪渠或排碱渠进入北沙窝，最后汇入东道海子。2012年5月现场考察发现，东道海子湖水受到严重污染，湖边死鱼随处可见，湖泊周边柽柳、
芦苇等植被已经大面积死亡，部分循环较差的区域湖水成棕红色，味道刺鼻；经初步检测，湖水的色度、浊度，PH，BOD、COD等常规监测项目都有较大程度的超标。经调查，排污渠沿线受到的影响更大，果树死亡、牲畜死亡的事件也时有发生。
东道海子是准噶尔沙漠最前沿“绿色屏障”，与周围发达的绿洲、密集的城镇、国际性交通干线唇齿相依，是昌吉、米东、乌鲁木齐最前沿的绿色卫士，生态区位与地理位置极为重要。其十分脆弱的干旱荒漠
湿地生态系统具有多样性、稀有性和濒危性，保护好东道海子干旱湿地生态环境，维持湿地的完整性、稳定性和连续性，充分发挥湿地的生态功能，有效保护该区域鸟类及珍惜植物，对维护整个
准噶尔盆地南缘的生态平衡和实现新疆天山北部绿洲
生态安全都具有显著的意义。