三山门是南京明城墙十三座明代京城城门之一，又称水西门，位于南京市秦淮区内秦淮河西端，坐东朝西，西临外秦淮河，为水陆两栖城门，南侧为西水关，是旧时从水路进出南京城的主要通道，故而俗称水西门。

杨吴时期，三山门始建。陆地城门原为建于南唐时的龙光门，一直沿用至两宋、元代，及至明代洪武年间，明代洪武初年仍直接利用这座旧有的城门。

明朝洪武十九年（1386年），在南唐龙光门的基础上重新建造，因南眺三山故而改名为“三山门”，紧靠南面的水门即西水关，原是南唐的下水门，明代建成水城门，后称为水西门。这水陆二门在南唐以来一直就是商旅繁辏之地，明清时期为西出要道，凡从城西进入应天府城的人都是从水城门上岸入城。三门外山，孙楚酒楼所在地有明初十六楼的“鹤鸣楼”、“醉仙楼”、“轻烟楼”、“淡粉楼”、“翠柳楼”等。

清朝康熙年间，建造觅渡桥，位于三山门外，旧名三山桥。壕水径此，与城内淮水合。

1953年，南京市人民政府拆除了三山门瓮城和三山门水城门。

1954年7月28日上午，由于常年雨水冲刷，年久失修，中华门瓮城一处裂缝出现险情，伤了人。接着下午2点，三山门瓮城第三道瓮城东南角倒塌，将“孙仁记扫竹行”西山墙压倒，伤了一个孩子。因此，当年的南京市政府决定拆除三山门瓮城。

1958年又拆除了残存的城门和城墙，1959年三山门门券及右侧城墙拆除后，内外秦淮河水系不再贯通，古亭被拆除，仅留水西门的地名，沿用。

三山门规模仅次于通济门和聚宝门（今中华门），形制与通济门略同，建有内瓮城三座，门垣共四道，每两道城墙间设瓮城，内瓮城呈船形或者鱼腹型，供作储兵防守之用。《南都察院志》说：“本门冲繁。南至聚宝门界，北至石城门界，长达七百一十五丈，垛口八百六十四座，城下门券四层，右边水关一座”。

三山门南侧的水关，即西水关，明代叫云台闸，为内秦淮和外秦淮合流处，是西水关明代金陵四十景中重要的一景。著名的孙楚酒楼就建在云台闸上，因唐代大诗人李白有“朝沽金陵酒，歌吹孙楚楼”之句，又称“太白酒楼”。该酒楼后几经损毁、重建，到清代时仍矗立在三山门秦淮河畔，在清代乾隆“金陵四十八景”中，第十三景即“楼怀孙楚”。旁边有赏心亭，西有白鹭亭，再往西为二水亭，下有折柳亭，与风亭相连的有佳丽亭等古迹。

三山门外辟有水西门大街，经过三山桥跨越秦淮河，通往外郭城江东门，两侧有分别有莫愁湖、南湖，如今的三山门遗址辟有水西门广场，众多城市干道在此交汇。

三山门遗址由分布于凤台南路两侧的东西两部分组成，东广场为内瓮城遗址，西广场为西水关遗址。在古代，瓮城作为城市的主要防御设施之一，一般在城门外，而南京明代的城墙则独创了内瓮城。内瓮城一般都为方形，三山门的船形内瓮城是南京现存的内瓮城实物，文物价值非常高。

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