1663年是一个平年，是农历癸卯年，是兔年。年号：明永历十七年，清康熙二年。它的第一天在星期一开始。

2月，曹玺以内务府郎中职，首任江宁织造。曹玺，满洲人，本属包衣（满语中奴仆之意），其妻孙氏是康熙帝的乳母。终康熙一朝，曹玺、曹寅、曹颙、曹頫祖孙三代，任此职长达六十年。

2月11日，康熙帝生母、慈和皇太后佟佳氏病逝。康熙帝在其母患病时期朝夕侍奉，及至母逝，寝食俱废，痛哭不已，近侍无不感泣。清廷专此隆重悼念。佟佳氏，吏部承政（尚书）、正蓝旗都统佟图赖女，顺治帝登基后，选为妃。卒年二十四岁，谥号为孝康章皇后。

2月19日，北京上空犹如战鼓擂鸣，随即，有陨石从天而降，落入城内者四颗，城外者七颗，合计十一颗。次日清晨，有人拾视，仍热如炽炭，一时传遍朝廷内外。其时，距康熙生母病逝仅九日，人视为奇事。

4月，惠更斯成为英国皇家学会第一个外国会员和并被巴黎科学院接纳为唯一的一个外国院士。

5月19日，应工科给事中吴国龙疏请，为杜绝款项繁多，易生奸弊。清廷规定：自康熙三年始，一应杂项赋役，俱称地丁钱粮，作十分考成。除每年正月扣拨的兵饷外，余者通解户部。各省均造简明赋役册，送交户部查实。有关颁给民间的易知由单，尽除其他各项名目。至于各部、寺衙门应用的钱粮，应在年前上报数目，户部则于次年支给，并仍在年终核报。

7月1日，波特再次率领由16艘夹板船、2600人和价值1370荷盾的货物组成的舰队，从巴达维亚出发，8月29日抵达闽江口，受到清方热情款待。

9月，奥军在埃尔塞库伊瓦尔战役中败北，但却在1664年8月的圣哥达战役中获胜。

9月7日，清廷恢复八旗乡试，取中的举人有满洲齐兰保等二十一名、蒙古布颜等十七名、汉军姚启圣等一百一十八名，均送吏部录用。

10月，清军攻占金门和厦门，沿海地区只剩下张煌言这一支弱军，屹立临门，清廷浙江招抚使王尔乐和总督赵廷臣连书招降他，他回书严词拒绝，称“执事为新朝佐命，仆为明室孤臣，时地不同，志趣亦异。功名富贵既付之浮云，成败利钝亦听天之命。”

11月18、19日，清荷联军攻击郑军，因寡不敌众，郑军退出厦门，不久又退出金门浯屿，退守铜山。

3月7日，维塔利出生于意大利博罗尼亚。

8月31日，阿蒙顿生于巴黎，1705年10月11日死于巴黎。

弘仁逝世，弘仁（1610—1663）一作（1610—1664）[清]僧。明诸生，甲申后为僧，号渐江，一号无智，人称梅花古衲，俗姓江，名韬。字六奇，安徽歙县人。少孤贫，性癖，以铅椠养母。卒年五十四。《黄山志》、《国[清]朝画徵录》、《图绘宝鉴续纂》、《桐阴论画》、《阿聪笔记》。

学者吴炎、潘柽章都死于此狱。二人曾撰《明史记》，未成。炎字赤溟，吴江人。柽章（1626－1663）字力田，吴江人。

12月7日，非洲历史上的贞德——恩津加逝世。安哥拉历史上有一名女英雄，被史学家誉为“非洲历史上的贞德”，她的名字叫恩津加。

“佟半朝”威名著朝野：康熙称帝后，世代忠于爱新觉罗氏的佟氏家族也迎来了它的鼎盛时期。在顺治、康熙、雍正、乾隆四朝，这个名门大族先后出现了两皇后、一贵妃和两驸马，至于尚书、督抚、将军等重要官职则遍及朝廷内外。他们位尊权重，显赫一时，时人称他们为“佟半朝”。佟氏，辽东大族，祖籍抚顺（辽宁抚顺县），世居佟佳江，以地为氏，历代经商，“雄资一方”。他们之中，首先归附后金（清）的则是佟养性，并成为皇太极改革中的重要人物。为铸造红衣大炮，佟养性贡献卓著。由他亲手创建的火器汉军成了后金（清）作战时必不可少的劲旅。其侄佟图赖为清廷定都北京，追剿抗清武装，屡立战功。其女为顺治帝妃。顺治十五年（1658），佟图赖病逝，谥襄勤，赠少保。康熙十六年（1677），康熙帝因其母系佟图赖女，特授他为一等公，命其子佟国纲袭爵位。同年，康熙帝又将其次子佟国维之女封为贵妃，后晋封皇贵妃，康熙二十八年（1689），册封为皇后，死后谥封孝懿仁皇后。