马玉昆（1837年－1908年），字荆山，亦作景山，民间称为马三元，安徽亳州市蒙城马集人。初以武童从毅军宋庆参加对捻军作战，积功至都司，后擢总兵。1874年与左宗棠部共同抗击阿古柏和沙俄侵略。1894年补授山西太原镇总兵，协助宋庆防卫旅顺口。7月朝鲜事急，奉令率军至平壤。在平壤保卫战中，他指挥所部奋勇抗击，重创日军第九旅团。但因主帅叶志超贪生怕死，指挥失当，终于败回国内。1895年在辽河下游与日军作战中，马玉昆虽英勇善战，但由于清军各部不协，仍以清军失败而结束。1899年擢浙江提督，次年调还直隶提督。

马玉昆家世代务农，家境贫寒。年轻时迁居雉河集（今涡阳县城），因身体高大，性强悍，少年尚武，臂力过人，又好赌躲债，曾被亳州蒋氏大户收为家丁。后往河南汝宁（今汝南县），投淮军所属的毅军营当兵。当时，毅军正在汝宁、南阳、邓州（今邓县）一带镇压捻军。因马玉昆作战强悍，在攻占仁山寨战斗中立有“战功”，受赏千总，戴蓝翎，并升任毅军统帅宋庆的亲军马队营官，为宋庆所赏识。

同治六年（1867 年），毅军调防山东东平州（今东平县），攻打张宗禹所率的西捻军，马玉昆舍命在前。随后，又在淮路口堵截捻军赖文光部。同年春天，马玉昆在山东济阳率领便衣，乘黑夜潜入捻营，内外夹攻，大败捻军。六月，马玉昆率部又在荏平围困捻军。不久，清廷将马玉昆提拔为副将，以总兵记名，并赏给“振勇巴图鲁”称号。

同治年间，西北回民起义爆发，陕甘总督左宗棠统兵前往，清廷调宋庆毅军从陕北榆林一带堵截陕甘回民军队。

1870年（同治九年），久攻回民据点金鸡堡不下，调马玉昆部参战破堡，击毙回军首领相文治壮。论功授马玉昆提督衔，赏“博奇巴图”称号。左宗棠平定陕甘回民起义后，又出嘉峪关镇压新疆回民军，清廷派宋庆任哈密剿匪会办。马玉昆奉宋庆派遣，随左宗棠、金顺出关入疆，得到器重。马玉昆参加平定乌鲁木齐、昌吉、玛纳斯等城，生擒回民首领黑瞎子，驱逐白颜虎逃入俄境。平定新疆以后，马玉昆又参加屯垦，先后驻守新疆达10年之久。清廷因马玉昆立有功劳，赏穿黄马褂，赐骑都尉世职。

1890年（光绪十六年），李鸿章调马玉昆任北洋军随办营务兼毅军后军，驻守旅顺。1891年（光绪十七年），清政府授马玉昆山西太原镇总兵。

1894年（光绪二十年）7月，中日甲午战争爆发，日本借口朝鲜内战，出兵入侵，朝鲜王室向清政府求援，清政府命马玉昆率毅军6营2000人前赴朝鲜，8月4日入平壤。与马玉昆部同时入朝者还有左宝贵奉军、卫汝贵盛军及丰升阿奉天练军盛字营等，共计29营，14000余人。清政府命叶志超为驻平壤各军总统。

9月15日，日军分四路围攻平壤。马玉昆率毅军分守平壤东门及大同江左岸防线。15日凌晨，日军第九旅团分左、中、右三路进犯大同江左岸毅军阵地，马玉昆指挥所部奋勇抗击。日军进攻部队被阻于阵地外开阔地面，毫无掩蔽，伤亡惨重。日军官不顾士兵死活，驱赶士兵拚死冲击，清军以猛烈炮火还击，日军“死伤甚多，如第十一联队第一中队将校悉数战死或负伤，第二十一联队第一大队第二、第四中队，其士官亦皆战死”。马玉昆指挥清军乘势由堡垒冲出，向日军发起反冲锋，展开白刃格斗。进攻平壤南路的日军第九旅团，在马玉昆指挥的毅军抗击下，遭受“将校以下死者约140名，伤者290名”的重大伤亡后，狼狈退出战场，清军取得保卫战的辉煌胜利。

但不幸，这时平壤玄武门被日军攻陷，奉军统领左宝贵力战牺牲。贪生怕死的叶志超急令撤退。当夜9时，叶志超率军由平壤仓皇溃退。一路被日军埋伏邀截，“人马腾 相蹂死者2000余人”，被俘500余人，伤者无算。叶志超率败兵狂奔500里，逃入中国境内。这样，马玉昆率部英勇奋战所取得的胜利，被畏缩怯懦的主将叶志超白白葬送了。

马玉昆率军退回国内后，10月，从毅军统领宋庆防守鸭绿江下游九连城防线。25日，日军由朝鲜义州越江来攻，首先进攻聂士成、马金叙防守的虎山阵地。在战斗危急时刻，马玉昆率部出援，奋勇杀敌。但由于守九连城的铭军刘盛休部，不战而溃，清军防线全线瓦解。马玉昆随宋庆退走凤凰城。30日，凤凰城又失，复退保摩天岭。

当时由辽东半岛花园口登陆的日本第二军入寇金旅，旅顺危急。清廷调毅军回援。马玉昆又从宋庆回军西进，先后与日军战于金州、海城附近之马圈子、感王寨。失败后，随宋庆退守田庄台。

1895（光绪二十一年）年2月下旬，清军数路联合反攻被日军占领的海城。24日，马玉昆、宋庆、徐邦道与日军战于大石桥附近的大平山。马玉昆率部防守山北之东、西七里沟急附近村落，奋力抵抗。并驰驱于冰雪间，督队力战。坐马中炮毙，重新易骑，继续督战。在战斗中，“马玉昆被围垓心，率其亲兵闯出重围，因见我兵尚在围内，重复杀入，冲开一路，护之而出，其亲兵百人两次冲杀，仅剩二十余人，战马三易，均被炮毙”。大平山之战是甲午中日战争的一次激烈战斗，双方伤亡惨重，日军除在战场上伤亡300余名外，并有大量士兵被冻伤，全军达千人以上。清军伤亡亦多，据宋庆所撰《大清敕建锦州毅军昭忠祠碑文》记载，毅军“死于大平山者四百二十四人”。

大平山失守后，马玉昆随宋庆退往营口，3月9日与日军战于田庄台。马玉昆分守田庄台东北曹家湾子，虽奋勇抵抗，但由于主将宋庆指挥失误，被日军分路包围截杀而失败。从此清军在辽南战场全部瓦解。不久，清政府战败，马关条约签订。甲午战争虽然失败了，但马玉昆的勇敢善战，却为日人所畏惧，如大平山之战，连日方的战史中也不得不承认：“此日之中国兵颇为顽强”，“忠勇力战”，“决无退却之色”。

1899年（光绪二十五年），马玉昆擢浙江提督。

1900年（光绪二十六年），调任直隶提督，适值八国联军侵华，八月，侵略军两万余人，沿运河北犯。马玉昆率武卫左军3000余人，配合义和团，在天津、北仓一带英勇抗击。因无援而退守南苑。后保慈禧太后、光绪皇帝逃往西安。光绪二十七年回京，加封太子少保，赏紫禁城骑马。

马玉昆关心家乡，任期内先后捐助蒙、涡两县及颍州府学费白银2．3万两，并捐资兴修界沟、葛沟两座石桥。皖北大水，派员到六安、周口筹粮万石，救济灾民。他为官数十年，衣服鞋袜均在家中自制。

1903年（光绪二十六年），日俄两国争夺中国东北边境，在中国境内交战，马玉昆奉命出关看守，驻守古北口至朝阳一线。

1906年（光绪二十九年），马玉昆撤防回京郊通州。

1908年（光绪三十四年），马玉昆在住所去世，享年71岁。清廷念马玉昆一生效忠，追赠太子少保，赏加二等轻骑都尉世职，照提督例赐恤，谥号忠武。其灵柩奉旨运回家乡，葬于涡阳城外的新卜宅。

马妻王氏，死于民国十一年（1922年）。次年，合葬涡阳西南香疃寺墓地（今楚店镇王油坊乡）。60-70年代墓被破坏，陪葬物品被盗，仅残存一墓志铭（盖），上书：“皇授光禄大夫建威将军太子太保直隶总督忠武公暨德配王夫人合葬墓志铭有序”。

《清史稿》：中日之战，淮军既覆，湘军随之，唯豫军强起支搘。庆与玉昆先后失利，亦不复能自振焉。东三省练军自成军后，终未当大敌，而依克唐阿、长顺一奋其气，遂保辽阳而无失，中外称之。丧师辱国者数矣，此固差强人意者哉。

天津人为了纪念这位马玉昆，在河北区内曾集资修建马公祠。据说，朝鲜居民为他建庙祭祀，把他与唐朝的薛仁贵、明朝的戚继光称为中国三杰，将三尊塑像并列在供台上。蒙城县政府投巨资对马玉昆故居马公馆将进行一次全面、彻底的抢救性维修。

《清史稿·列传二百四十八》