浙江处州南山村人。明弘治六年（1439）中进士，初授行人，后选为御史，执行风纪法令严厉，不徇私情。时，司礼监太监刘瑾专权，宣不赴炎趋势，以平等的礼节相待，得罪刘瑾，被贬谪到兴化（今莆田）任推官。多善政，莆田立生祠祀奉他。不久升任江西佥事，因御寇有功，升任参议。后辞官回乡。卒后葬丽水城东望城岭。

郑瑄，字汉奉，号昨非庵居士，福建省闽县（今福州）下渡人。自幼天资聪慧，读书过目不忘。祖父郑日休，明嘉靖年间举人，官教谕。父郑元勋，县秀才。祖父、父亲都游学北京，教授学生数百人，郑瑄因而遍交海内名士。考中明天启四年（1624年）举人，崇祯四年（1631年）进士，授南京户部主事，升渡支使，主管仓库和钱粮簿书等。后出任浙江嘉兴府知府，重视教育，兴修水利，深受百姓爱戴。数年后，任应天（今南京）巡抚，他为官清廉，一芥不取，生活清苦，妻子穿戴仍荆钗布裙。他说：“余为三品堂卿，几六年矣，萱帷布衾，制自微时。间欲更葺，亦不易措。”当时北方发生饥荒，流民纷纷逃难到南京，但南京百姓赋役繁重，民不聊天，有武生李琎，建议搜刮江南富裕人家财力以充军饷，受到钱士升的极力反对。郑瑄当即引退回乡。

唐王朱聿键在福州建立隆武小朝廷，授郑瑄为工部尚书加太子太保，郑瑄与大学士黄道周、巡抚张肯堂同心辅政，而当时武将专横跋扈，朝廷命令不能传达几州，隆武二年（1646年）朱聿键兵败被杀，郑瑄郁郁不得志，不久死于家中。后祀于嘉兴六贤祠。

郑瑄喜读书又精通文学，与学者倪元璐、徐石麟“以文章相引重”。郑瑄著有《抚吴疏草》四卷不传于世。又著有《昨非庵日纂》二十卷，“昨非庵”是郑瑄官署中的书室，郑瑄《自序》说：“使余而知昨之非也”。时时警示自己。此书是他的读书笔记，从历代正史、诗文集、野史、杂记等书中分门别类采集而成的，“此书皆记古人格言懿行”。他说：“兹编事不炫奇僻，语不求绮奥，取其有关世教、伦常、修德、释回，足当迷津一筏者。”希望能教化世人，为人们作一行动指南，此书刚刻板问世，立即引起朝野的关注，有人把它比作西汉刘向的《说苑》。不久，此书传入日本，受到欢迎，四百年来一直轰动日本商界。此书为明刻本、石印本，近年都有影印本。1995年中州古籍出版社又有“文白对照全译”本上下两册，极便于读者。