抗广谱抗生素长期使用，使敏感菌受到抑制，不敏感菌（如真菌等）趁机在体内繁殖生长，造成二重感染，又称菌群交替症。合并应用肾上腺皮质激素，抗代谢或抗肿瘤药物更易引发二重感染。

抗菌药物的使用可致菌群改变，使耐该种抗菌药物的微生物引发新的感染。引起新感染的细菌可以是在正常情况下对身体无害的寄生菌，由于菌群改变，其他能抑制该菌生长的无害菌为药物所抑杀后转变为致病性菌，或者也可以是原发感染菌的耐药菌株。

但是，当长期、大量使用广谱抗菌药物时，情况就发生了根本的改变：使原本并不致病的微生物增殖机会大增，也可以导致人体发生感染，尤其对抵抗力低下的病人，如癌症患者、肺心病患者，以及老、幼、病、残者更是如此；这种情况在医学上也称为条件致病菌引起的感染；当然，二重感染也可以由原发感染菌的耐药菌株引起。临床上发生的二重感染常见的有霉菌性肺炎、梭状芽胞杆菌肠炎、霉菌性肠炎、口腔霉菌感染、白色念珠菌阴道炎，以及尿路感染等。

(1):真菌病，致病菌以白色念珠菌最为多见。表现为口腔鹅口疮、肠炎、可用抗真菌药治疗。

(2):葡萄球菌引起的假膜性肠炎，此时葡萄球菌产生强烈的外毒素，引起肠壁坏死，体液渗出，剧烈腹泻，导致失水或休克症状，有死亡危险。这种情况下必须停药并口服万古霉素。

①严格控制适应证,避免抗生素的滥用;

②除非有明确指征的严重混合感染，选用广谱抗生素外,对一般感染应根据症状诊断和药敏试验， 使用具有高度选择性的窄谱抗生素;

③根据具体病情，合理控制使用剂量和 时间;

④对长期大剂量应用广谱抗生素，尤其与免疫抑制剂联用，出现原因 不明的发热、腹泻或肺炎，应用抗生素治疗无效时，应考虑二重感染，可试用 抗真菌药物，如两性霉素B、氟胞嘧啶或氟康唑，并注意改善患者的机体防御 功能(应用新鲜血或白蛋白)及周围环境的消毒或隔离。