霉菌属真菌范围，致病性霉菌的种类一般不下20余种，造成霉菌性肠炎最常见的是一种叫白色念珠菌的真菌。它除引起肠炎外，对整个消化道都可侵犯，人们一直听说的“
鹅口疮”就是白色念珠性口腔炎的俗称。其他常见的还有念珠性
食道炎等。本病一般只限于抵抗力被疾病或药物消弱的患者，多见于因肿瘤而行放化疗的病人，以及长期接受抗生素或激素治疗、有糖尿病等消耗性慢性疾病、长期营养不良的人群。由于该菌在正常人群中有健康带菌或真菌易感者，一旦抵抗力下降或服用抗生素不当，正常人偶尔也会发病，但较为短暂，易于治愈。
大多发生在应用抗生素治疗后，轻者腹泻水样，重者水便中可见漂浮脱落的伪膜，甚至泻下血样便，每日可达10次以上。本病常继发于上消化道念珠菌病，可见“
鹅口疮”，侵犯食道时还可见
咽痛、
吞咽困难、厌食、呕吐，甚至呕血。皮肤局部一般也有念珠菌感染、糜烂的征象。正常人患病有时仅有不明原因的腹泻，其他症状缺如或轻微。严重的患者念珠菌可扩散全身，引起其他呼吸、中枢神经组织的病变，以至出现
败血症、
休克等危急征候。
中医认为，霉菌性肠炎多在脾胃
气阴亏虚的基础上发生，气虚则推动无力，阴亏则胃肠失于濡润下降，最终导致肠道气机运行不畅，浊邪内聚不散，久而蕴成湿热毒邪，久留不去。