翼手龙亚目（Pterodactyloidea）是
翼龙目的一个亚目，分布于晚侏罗世至白垩纪末，后期的一些种类个体很大。这类翼龙以牙齿不甚发育或完全消失，鼻孔与眶前孔不相分隔甚至完全融合，枕髁朝向后下方，后期更进步的类型具有联合背椎，尾短，翼掌骨长，后肢第五趾退化等特征与
喙嘴龙亚目相区分。
翼手龙亚目可分为十几个科，如：翼手龙科（Pterodactylidae）、梳颌翼龙科（Ctenochasmatidae）、古魔翼龙科（Anhangueridae）、准噶尔翼龙科（Dsungaripteridae）、古神翼龙科（Tapejaridae）、夜翼龙科（Nyctosauridae）、鸟掌翼龙科（Ornithocheiridae）、南方翼龙科（Pterodaustridae）、
无齿翼龙科（Pteranodontidae）、阿奇达翼龙科（Azhdarchidae）等。中国已报道的翼手龙亚目的属已有十余个。
目前已知最早的
翼手龙类化石，发现于
英国的Taynton石灰岩组地层，地质年代约1亿6600万年前，相当于
侏罗纪中期的
巴通阶。这些标本极可能属于梳颌翼龙超科。