天启初年，
奢崇明叛乱，攻陷
重庆，牟文绶随军收复重庆，并擒获樊龙，升
贵州守备。
安邦彦叛乱，牟文绶擒获酋长罗妙国，解除包围，历任
都司、
游击、
参将。追擒贼首王大头，与兄牟文禄破敌于禄广河。牟文禄战死，调守徉俍，筑造城池。
崇祯十年（1637），张献忠、
罗汝才攻破
和州，被牟文绶与
刘良佐所击退。牟文绶跟随
朱大典屯兵舒城，不久率军护卫
明祖陵。
摇天动、张献忠、罗汝才率二十余万攻城略地，牟文绶留两千人守
桐城，击破入侵舒城的敌军。后命专辖凤阳、
庐州、
淮安、
扬州、
徐州。