中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室于2003年批准建设，依托单位为中国水稻研究所和浙江大学，于2006年12月通过建设验收，并在2006年度
生命科学领域国家重点实验室评估中被评为优秀实验室。实验室现有固定人员47人，其中博士生导师24名、国家杰出青年基金获得者7名、国家新世纪百千万人才5名。
水稻生物学
国家重点实验室依托
中国水稻研究所、
浙江大学，实验室是以原农业部重点开放实验室为基础，结合浙江大学相关学科开展建设。2003年11月，通过科技部组织的实验室建设计划的专家论证，12月被列入国家重点实验室建设项目。实验室现任主任
钱前研究员；学术委员会主任
李家洋院士。
实验室以水稻资源学研究和分子育种为重点,开展水稻生物学研究，为稻作科技发展提供先进的资源平台、技术平台和理论平台。围绕此中心任务，确定以水稻种质改良与创新的遗传学、水稻发育生物学、水稻环境生物学和分子育种为主要研究方向。具体研究内容为：1、水稻种质改良与创新的遗传学基础研究，包括：优异种质资源的发掘、创新和利用，稻的演化、
遗传多样性及保护生物学研究，遗传学重要研究材料构建及重要性状的遗传研究；2、水稻产量与品质基础理论研究，包括：杂种优势机理，理想株型塑造理论，品质形成机理；3、水稻环境生物学研究，包括：水稻与环境的相互作用，水稻有害生物的可持续控制，转基因水稻的环境安全性；4、水稻分子育种研究，包括：基因定位与克隆，
转基因技术，分子标记辅助选育技术，分子设计和
生物反应器等。
原农业部水稻生物学重点实验室成立于1993年，实验室通过十余年运行，应用综合技术手段，开展水稻生物学重大的基础和应用基础研究，形成了多性状综合分析重要种质、多学科协作创造重要材料、多途径并举攻克重要难题的特色，确立了在遗传育种、种质资源保存和利用、生物技术研究上的优势，取得了许多重要研究成果，如：建成了国内最大的水稻单项作物种质资源库和国内最大的水稻T-DNA插入突变体库；应用杂交水稻亲本选配理论和株型塑造理论，育成“汕优10”等主栽组合和
超级杂交稻组合“
协优9308”；发掘新的细胞质源，拓宽雄性不育细胞质的遗传基础，育成生产上大面积应用的印尼水田谷型不育系“中9A”；发掘、定位和克隆了多个重要基因，其中合作克隆的控制分蘖性状的基因，在《NATURE》上发表；首创转基因杂交稻，应用
分子标记辅助选择技术，在国内首次成功育成并通过省级审定的抗病杂交稻新组合“
协优218”和“
中优218”；形成了一套模拟研究田间转基因水稻花粉飘移规律的新方法，为转基因安全评价提供了一种新方法。
实验室先后取得国家科技进步一等奖、二等奖、三等奖及国家自然科学三等奖等重大成果。浙江大学的相关学科农业昆虫与害虫防治学、植物病理学和生物物理学分别是国家重点学科、农业部重点学科和浙江省重点学科，均为“九五”和“十五”211工程重点学科建设项目。多年来，在传统学科研究基础上，发展了寄主-害虫-天敌相互关系、植物与病原互作分子机理和
转基因作物风险评价等方向，形成了应用分子生物学为主导内容的学科特色，在水稻抗病虫机理、有益生物利用和转基因作物生态评价等方面取得大量成果，在国内具有重要的学科地位和影响。自2001年首次参加国家重点实验室评估并取得良好成绩以来，实验室共获得省科技进步一等奖1项，二等奖3项，三等奖3项；取得发明专利3项。在核心期刊发表论文179篇，其中SCI收录30篇；出版专著9本。
实验室强调合理设置学科，系统性强，形成了多学科协作攻关的特色。如农业部跨越计划项目“中国超级稻研究与示范”，就集中了资源学、遗传学、栽培学、生理学、分子生物学以及生态学、昆虫学、植病学等方面的优秀人才，形成了一支优势集成、思路多元化、研究系统化的强有力的科研团队。实验室现有固定人员30名，其中国家和省部级突贡专家3名、国家杰出青年基金获得者1名、浙江省151工程第一层次人才6名、教育部跨世纪人才1名，有博士生导师12名。实验室45岁以下的中青年科研人员中21人拥有博士学位，占实验室人员的70%。实验室聘请了15位知名专家和学者组成学术委员会。
实验室积极遵循“开放，流动，联合，竞争”的基本方针，与中科院、
中国农业大学、浙江大学等科研单位与院校开展了广泛的合作，共同承担科研课题、合作培养研究生，充分实现作到资源共享。与日本JIRCAS、美国CornellUniversity、Syngenta公司、法国国际农艺研究发展中心以及联合国粮农组织、印度、埃及、俄罗斯、菲律宾、意大利、比利时、奥地利、香港等国家地区的科研单位和大学都有合作项目。在未来五年的建设发展中，实验室的努力目标是在杂种优势理论及应用研究上，进入世界前沿；分子设计育种研究、水稻有害生物致害性机理研究取得重要进展；稻米品质机理、转基因水稻环境安全性研究国内领先。建成我国资源最丰富、数据最全、利用效率最高的水稻种质库，成为稻作科技界共享的资源平台。完善分子生物学、基因工程、生理生化及环境生物学四个公共实验平台，面向国内外开放。