中国水稻研究所是以水稻为主要研究对象的多学科综合性国家级研究所，隶属于中国农业科学院和浙江省人民政府双重领导。

1981年6月，经中华人民共和国国务院批准，中国水稻研究所在杭州建立

1989年10月，中国水稻研究所落成。

2002年，经中华人民共和国科技部等部门批准，中国水稻研究所为非营利性农业科研机构。

2007年7月，中国水稻研究所赣州新品种试验站在江西省赣州市挂牌成立。

2016年3月，中国水稻研究所与巴基斯坦共建中巴杂交水稻联合研究中心。

2018年8月，中国水稻研究所北方水稻研究中心在黑龙江省双鸭山市宝清县正式揭牌成立。

2020年11月，中国水稻研究所上山稻作研究基地在浙江浦江成立。

2022年3月，中国水稻研究所与重庆市农业科学院共建中国水稻研究所西南水稻研究中心。

截至2022年6月，中国水稻研究所拥有工作人员500余人，其中，中国工程院、中国科学院院士各1人，中高级科技人员250人，博士生导师37人，具有博士学位148人，硕士学位58人。同时还聘请中国国内外科学家担任兼职研究员。

中国科学院院士（专职）：钱前

中国工程院院士（专职）：胡培松

国务院政府特殊津贴获得者：钱前、程式华、胡培松、魏兴华

中华农业英才奖获得者：程式华、胡培松

全国杰出专业技术人才：胡培松

截至2022年6月，中国水稻研究所下设国家级改良中心1个，国家级技术研究与发展中心1个，农业部质量监督检验测试中心1个，技术信息中心1个，地方研究中心1个和国家重点实验室1个，简称为五个中心、一个实验室。

国家重点实验室：水稻生物育种全国重点实验室

国家级改良中心：国家水稻改良中心

国家级技术研究与发展中心：稻作技术研究与发展中心

农业农村部质量监督检验测试中心：农业农村部稻米及制品质量检验测试中心

技术信息中心：水稻科学技术信息中心

地方研究中心：北方水稻研究中心

截至2022年6月，中国水稻研究所位于杭州市，拥有一个包括实验室群、试验农场等在内的科学实验基地，占地5300余亩。建有科学实验楼、图书信息楼、生物工程楼、水稻种质库、人工气候箱群、温室、访问科学家与进修培训人员宿舍及其他配套设施，总建筑面积11万平方米。实验室中配备有近3亿元的仪器设备。在海南陵水县建有海南试验中心。在黑龙江宝清县建有北方水稻研究中心。图书馆拥有中外藏书4万余册。

据2023年12月研究所官网显示，中国水稻研究所自1981年建所以来，先后与美国、欧盟、俄罗斯、日本、韩国、澳大利亚、印度、越南、泰国、菲律宾、巴西、埃及、联合国粮农组织、国际粮食政策研究所、国际水稻研究所、瑞士先正达公司、美国水稻技术公司、比利时DEVGEN公司等多个国家、国际组织及国际跨国公司建立合作关系，开展水稻生物技术、遗传育种、农艺栽培、品种资源等众多领域的合作研究。

2020年10月25日，北大荒集团与中国水稻研究所战略合作签约仪式在北京举行。

2023年11月19日，安徽荃银高科种业股份有限公司与中国水稻研究所举行科企合作签约仪式。

2019年12月5日，中国水稻研究所获“全国农业植物新品种保护先进集体”称号。

截至2022年6月，中国水稻研究所共取得省部级以上获奖成果141项次，国家级获奖成果25项，涵盖了国家自然科学奖、国家技术发明奖、国家科学技术进步奖三大奖项。1997年、1998年、2000年、2003年、2010年和2016年分别有成果入选中国十大科技进展和中国十大科技新闻。成果年应用面积在1.5亿亩以上，取得了巨大的社会经济效益。

《中国水稻科学》为中国水稻研究所主办的学术性双月刊，创刊于1986年。主要报道以水稻为研究对象的原始论文。所设栏目包括研究报告、研究简报、研究快报、研究简讯、实验技术、学术专论、文献综述等。该刊为中文核心期刊、中国科学引文索引数据库核心期刊、中国科技核心期刊、中国科技论文统计数据库核心期刊，影响因子在同类期刊中名列前茅。

《Rice Science》（水稻科学）为中国水稻研究所主办的国际性、学术性、专业性英文双月刊，由原先的《Chinese Rice Research Newsletter》更名而来。该刊刊登以水稻为研究对象的未经发表的英文原始论文（Research Paper）、综述与专论（Review or Special Topic）、研究简报（Short Communication）等。

《中国稻米》是中国水稻研究所主办的全国性水稻科学技术期刊，为双月刊，中国国内外公开发行，《中文核心期刊要目总览》期刊、中国科技核心期刊。该刊主要刊登以水稻为研究对象的专论与综述、专题研究报告、学术论文、新技术新方法研究成果、综合信息等。设有“专论与研究”“ 品种与技术” “各地稻米”“综合信息”等栏目。

截至2023年9月，中国水稻研究所拥有一级学科博士学位授权点5个、一级学科硕士学位授权点5个、二级学科博士学位授权点6个、二级学科硕士学位授权点3个、专业硕士学位授权领域4个。

一级学科博士学位授权点：生物学、食品科学与技术、作物学、植物保护、农林经济管理

一级学科硕士学位授权点：生物学、食品科学与技术、作物学、植物保护、农林经济管理

二级学科博士学位授权点：微生物学、生物化学与分子生物学、作物栽培学与耕作学、作物遗传育种、植物病理学、农业昆虫与害虫防治

二级学科硕士学位授权点：食品科学、杂草学、农业经济管理

专业硕士学位授权领域：农艺与种业、资源利用与植物保护、食品加工与安全、农业管理

截至2023年11月，中国水稻研究所拥有博士生导师35人，硕士生导师102人；已培养毕业研究生494人，其中博士135人，硕士359人；目前在校生290人。

中国水稻研究所所徽内部为太阳神鸟，中央为稻穗，为研究所的主要工作是水稻，外部分别为研究所的中英文名称。

中国水稻研究所所歌为《春华秋实粮满仓》，由申红芳作词，段瑞雷作曲。

所训：精耕细作、春华秋实

方针：立足浙江、面向全国、放眼世界

2023年9月17日，中国水稻研究所举办“舌尖上的味稻”全国科普日活动。