毛利秀元（1579年11月25日－1650年11月26日、天正7年11月7日-庆安3年闰10月3日）是日本安土桃山时代武将，江户时代大名、长府藩第一代藩主。他是毛利元就之孙，穗井田元清的长子，一度成为堂兄毛利辉元的养子。

毛利元就四男穗井田元清长男。正室是丰臣秀长女儿大善院，继室是德川家康养女净德院。曾一度成为毛利辉元的养子。育有三子八女，长男宫松丸早逝、次男毛利光广、三男毛利元知。

1579年（天正7年）11月7日生于备中猿挂城，幼名宫松丸，五岁成为毛利辉元养子，直到1595年毛利辉元长子毛利秀就出生后才自立。早年参与文禄·庆长之役。其中在庆长之役最为活跃，代替患病的辉元率领3万大军，任右军大将。与加藤清正、黑田长政、锅岛直茂包围黄石山城，占领全罗道、忠清道。之后在天市接到黑田长政遭明军突袭的消息，秀元立即救援，成功击退明军。在冬季秀元准备返回日本时，驻留蔚山。在输送兵器前往釜山时，明军和朝鲜军攻击蔚山，秀元返回蔚山救援，成功击退朝鲜军。

关原之战，毛利军所属西军，总大将毛利辉元留守大坂城，毛利秀元是毛利军的前线指挥。由于受到吉川广家已成为德川家康内应的影响，对于作战相当消极。结果在关原的战斗上，吉川广家束缚了毛利家、长宗我部家的军势。其后西军阵势瓦解，毛利军亦宣告撤退。

当毛利军返回大坂城时，毛利秀元及立花宗茂等将曾要求毛利辉元积极战斗，但是辉元最终撤离大坂城。

关原之战后，毛利秀元成为长府藩6万石藩主。并将德川家康养女纳入继室，参加大坂之役。晚年在江户城居住，成为江户幕府第三代将军德川家光的御咄众。曾经引诱毛利就隆脱离长州藩独立，但失败而归。1650年在江户城病逝，享年72岁。墓地在泉岳寺、功山寺及丰功神社。法号为寺功山玄誉大居士。