藩主
毛利氏，十六世纪中叶藩族
毛利元就以
安艺郡吉田城为据点，领有中国地方十国120万石，其孙
毛利辉元与
织田信长对抗。信长死后与
丰臣秀吉妥协，参加执政，为
五大老之一。
关原之战时为西军总大将，战败后被德川减封，领有
周防、长门两国29.9万石(
检地后为36.9万石)。由于这次大减封，长州藩重新丈量土地，甚至把年供外的杂税小物成，楮木、盐田等都算入村高，以增加石高，同时实现国产品
专卖制，以补充财政之不足。自1682年（天和2年）以来，屡次发布《
节俭令》，削减
藩士的知行，增收
年贡，但并未解决财政的亏空。第七代藩主重就实现所谓宝历检地，坚决推行
藩政改革，结果增收三万石，以此为基金设置抚育方，为以后开发
新田和在地方商人协助下实现国产品专卖奠定了基础，然而藩债不断增加，造成农民穷困，因此近世中期以后各地不断发生百姓一揆。
1831年（天宝2年）以
濑户内海沿岸为中心，终于爆发了反对
专卖制度的大暴动，以此为契机，以
村田清风为首的改革派上台，计划
紧缩财政开支，重建乡村的统治。紧接着，周布政之助等从当时围绕开港问题的中央政局和海防需要出发，采取富国强兵和
重商主义的政策，长州藩很快成为尊王攘夷派的据点，经过
文久3年（1863年）
八月十八日政变及幕府两次
征伐长州以后，与
萨摩藩同为
讨幕运动的推动力量。
1865年（
庆应元年）藩厅迁至周防山口，直到
废藩置县。维新后，长州出身的人也是政府的权利中坚，以后该藩出生的官僚，军人形成了长州阀，在政界起支配作用。