樊毅，字智烈，南阳湖阳（今河南唐河）人。樊毅出身将门世族，年少时即习武善射。他的祖父樊方兴，在
南梁时仕至
散骑常侍、仁威将军、司州刺史，鱼复县侯；父亲樊文炽，官至散骑常侍、
信武将军、益州刺史，新蔡县侯。
侯景反叛，樊毅率家兵随叔父樊文皎入援京师
建康。樊文皎于
青溪战死，樊毅带领宗族子弟前往
江陵归附
王僧辩，讨伐河东王
萧誉。讨伐胜利后，樊毅因功授任为
假节、
威戎将军、
右中郎将，又代替兄长樊俊任梁兴
太守，兼任三州
游军。樊毅后随从宜丰侯
萧循平定湘州
陆纳叛乱，樊毅随宜丰侯
萧循于湘州征讨
陆纳。樊毅军队刚到
巴陵，还未安营扎寨，陆纳就连夜来袭，敌军来到樊毅军营前大声鼓噪，士兵们十分恐惧，樊毅率领数十人，在营门前奋力拼杀，斩杀敌军十多首级，然后击鼓传令，军心才安定下来。因功授任为
持节、
通直散骑常侍、
贞威将军，封为夷道县伯，食邑三百户。不久樊毅又任天门太守，进爵为侯，增加食邑至一千户。
西魏围攻江陵时，樊毅率兵赴援，但江陵最终陷落，樊毅为岳阳王
萧詧俘获，不久后成功出逃回朝。
太建初年，樊毅转任丰州刺史，封为高昌县侯，食邑一千户，入京任
左卫将军。
太建五年（573年），陈宣帝
陈顼下诏命众军北伐，九月樊毅率部攻下广陵楚子城，十月樊毅在颍口击退北齐军，又再击破救援沧陵的北齐军队。十一月樊毅攻克济阴城。
太建七年（575年）一月，樊毅攻下潼州城，二月又攻破
下邳、高栅等六城。
太建十年（578年）二月，
司空吴明彻在对北周作战时失利，于吕梁战败，三月朝廷诏令樊毅为
大都督，统领朱沛、清口上至荆山沿淮水一线诸军，进号
平北将军，四月樊毅率部渡过淮水，在清口筑城，与北周相抗。时遇上连绵大雨城墙损坏，樊毅便率全军而返，九月迁任
中领军。
太建十一年（579年），北周将领
梁士彦率兵包围寿阳，朝廷诏令樊毅为
都督，北讨前军事，加安北将军，樊毅率水军二万自东关进入焦湖。不久樊毅又受任为
镇西将军、都督荆、郢、巴、武四州水陆诸军事。
太建十四年（582年），陈后主
陈叔宝即位，樊毅入朝担任
侍中、
护军将军，进号
征西将军，进爵逍遥郡公，食邑三千户，官号如故。隋军渡江入侵，樊毅建议
仆射袁宪各调数千精兵和二百战船至京口、采石这两个重要据点，将战船投到江中，水陆共同防卫，否则大势将去。诸将都赞成樊毅的建议，但
施文庆等人隐瞒隋兵消息，因而樊毅的计策未能实施。建康被隋军攻陷，樊毅被俘进入长安，不久就去世了。
● 北伐建勋：
太建北伐中，樊毅率部攻下楚子城，又再击破北齐大军，攻取城池，与北周相抗。
李延寿：钱道戢、骆文牙、孙玚、徐世谱、周敷、荀朗、周炅、鲁悉达、广达、萧摩诃、任忠、樊毅等，所以获用当年，其道虽异，至于功名自立，亦各因时。当金陵覆没，抑惟天数，然任忠兴亡之义，无乃致亏，与夫萧、鲁所行，固不同日。持此百心，而事二主，欲求取信，不亦难乎。首领获全，亦为幸也。（《
南史》）