有机磷杀菌剂（organophosphorus fungicide）是具有杀菌或抑菌活性的含磷有机化合物杀菌剂。其基本化学结构是磷酸酯、硫代磷酸酯、磷酰胺类等。此类药剂中有对各种白粉病、水稻病害和各种卵菌有效的内吸性杀菌剂。

特点：大多具内吸性，可茎叶喷雾、土壤施药、水田撒施等，低残留，最终代谢产物为磷酸、亚磷酸，使用不当，病原菌可产生抗药性，但不同类型的有机磷杀菌剂之间也存在负交互扰性。

主要品种有威菌磷、吡嘧磷、三乙膦酸铝(乙膦铝)、甲基立枯磷、稻瘟净、异稻瘟净等。

有机磷杀菌剂的主要品种有：O,O－二乙基－S－甲基二硫代磷酸酯是棉立枯病很有效的杀菌剂；S,S,S,－三甲基四硫代磷酸酯的作用更强；O－乙基－S,S－二苯基二硫代磷酸酯的商品名为克瘟散，对稻瘟病有效，对作物无害;O－正丁基－S－乙基－S－苄基二硫代磷酸酯的商品名稻可宁，是水稻杀菌剂；O－甲基－S－苄基苯基硫代磷酸酯的商品名为甲苯稻瘟净；O－甲基－O－环己基－S－（4－氯苯基）硫代磷酸酯的商品名为绿稻宁，是杀菌剂；N,N,N,N－四甲基－O－五氯苯基磷酰二胺的商品名为TH184-F,对白粉病很有效。具有酸性的NH基的磷酰胺有杀菌作用，最有代表性的是O,O－二乙基－N－邻苯二甲酰亚胺基硫代磷酸酯，商品名DOWCO199(或49)。O,O－二乙基－S－苄基硫代磷酸酯的商品名为稻瘟净，可防止稻瘟病；异稻瘟净是其相应的二异丙酯，是一个内吸性水稻杀菌剂；O，O－二乙基－O－【5－甲基－6－乙羧基吡唑并－(1,5a)－嘧啶基－2】硫代磷酸酯的商品名为Hoe2873，可防治白粉病;磷霉素是天然存在的一种有机磷化合物，可用作抗生素。