日本为发动太平洋战争，进攻南太平洋及东南亚地区所组建的部队。1941年11月5日，日本御前会议决定对美国、英国、荷兰开战，从关东军、中国派遣军、台湾军中各抽出一部分组成。翌日发布其战斗序列：总司令官寺内寿一大将，总参谋长冢田攻中将，下辖第十四军(司令官本间稚晴中将)、第十五军(司令官饭田祥二郎中将)、第十六军(司令官今村均中将)、第二十五军(司令官山下奉文中将)，及南方军直辖第二十一师团、第二十一独立混成旅团、第四独立混成联队、第三、五飞行集团、南海支队等部。12月4日，南方军总司令官寺内从台北进抵西贡。同日第二十五军自三亚启航，驶向马来半岛。珍珠港事件第二天，南方军攻入泰国曼谷。1942年1月2日占领马尼拉，继而攻占新加坡、缅甸、菲律宾、印度等地。随着太平洋战争爆发后美英参战，南太平洋及东南亚地区战火蔓延，日军大本营不断增强兵力，至1945年8月，南方军辖缅甸方面军(司令官本村兵太郎大将)、第七方面军(司令官板垣征四郎)、第十四方面军(司令官山下奉文大将)、第十八方面军(司令官中村明人中将)、第八方面军(司令官今村均大将)，总计15个军的兵力。1945年9月初日本无条件投降后，散布于南太平洋各岛屿及东南亚各国的南方军所属各部，分别向美国太平洋舰队、英军蒙巴顿元帅及澳军司令投降，旋即撤销战斗序列。

南方军是一个战略战役军团，直属于东京的陆军大本营。与之同级的，还有关东军，中国派遣军和驻守日本本土的第一总军和第二总军。主要作战于东南亚地区（越南、泰国、缅甸、印度、马来西亚、印度尼西亚、新加坡等英荷远东殖民地）和太平洋地区（菲律宾、中南太平洋诸岛等美国殖民地和澳大利亚控制下的新几内亚、所罗门群岛等南太平洋岛屿）。日本把大量的甲种师团编入南方军，主要与美国作战。

西方国家的集团军〉，每军又下辖若干师团（相当其它国家的加强师、整编师）。师团是日军最基本的战术兵团，由于日本没有独立的空军，航空兵归属陆海军建制。因此，南方军除辖有大量的地面部队外，还直接掌握着航空部队。

1941年12月时，日本陆军的总人数达到了210万人，第一线飞机约2512架，南方军分占其中的20%和28%。确切地说，它并不完全是一支新军，所部有很多是抽自其它战区的精锐兵团。

譬如，来自中国派遣军的部队，大多数已有4年的实战经验，特别是第5师团，擅长登陆动作，中日战争以来转战各地，历经百役。原属关东军的第5飞行集团，因参加过炽烈的苏日诺蒙坎空战享有盛名。此外，在南方军编内还破天荒地集结了9个坦克联队〈相当于坦克团〉，日军的坦克力量向来薄弱（这样的联队当时总共只有I5个），真可谓下了血本！高级指挥官寺内寿一、山下奉文、今村均、本间雅晴等，历来是日军大本营倚重的骁将，自侵华战争以来已积累下指挥大兵团作战的丰富经验。寺内寿一出身世家，其父是日本著名首相，元帅寺内正毅。寺内寿一本人也曾担任过陆军大臣、北支那方面军司令等要职，在日军现役大将中，他和陆相杉山元、关东军司令官植田谦吉并称为“陆军三最峰”。山下奉文则素以胆大凶悍著称，曾任关东军防卫司令官，又刚从德国、意大利考察坦克新战术归来，正欲施展一番。后来，他在马来战役中进军神速，作战得力，因而获得“马来之虎”的绰号。

寺内寿一

军政监部总务部长

高桥坦：昭和17年7月9日～昭和19年10月14日（总参谋副长兼任）

西大条胖：昭和19年10月14日～终战（总参谋副长兼任）

神田实：昭和20年2月20 - 终战

森武夫：昭和16年11月6日～和住吉三郎：昭和20年4月7日～

青木九一郎：昭和16年11月6日～椰野岩：昭和19年3月1日～

冈村畯儿：昭和17年4月1日～日高巳雄：昭和18年6月15日～

太平洋战争初期编制

太平洋战争末期编制

1945年9月12日，板垣征四郎大将（新任第7方面军司令官）代表南方军尚存的74万官兵，在新加坡签订降书。按照盟军的命令，北纬16度以北的第38军向中国国民党军队投降，菲律宾的第14方面军残部向美军投降，其余地区约50万人向英军投降。

当时全军部队主干序列如下：

缅甸方面军（司令部在毛淡棉）：第28军（第54师团，独立混成第72旅团），第33军（第18、第49、第53师团），直辖之第31、第33、第56师团，独立混成第24、第105旅团。

第7方面军（司令部在新加坡）：第25军（近卫第2师团，独立混成第25旅团），第29军（第37、第94师团，独立混成第35、第36、第37、第70旅团），第16军（第48师团，独立混成第27、第28旅团），第37军（独立混成第56、第71旅团），直辖之第46师团，独立混成第26旅团。

第14方面军（司令部在吕宋）：第35军（第1、第16、第26、第30、第100、第102师团，独立混成第54、第55旅团，步兵第68旅团），第41军（第8师团），直辖之第10、第19、第23、第103、第105、坦克第2师团，第1挺进集团，独立混成第58旅团，第4飞行师团。

第18方面军（司令部在曼谷）：第15军（第4师团），直辖之第15、第22师团，独立混成第29旅团，曼谷防卫队。

南方军直辖：第14师团（独立混成第49、第53旅团），第2军（第5、第32、第35、第36师团，独立混成第57、第128旅团），第18军（第20、第41、第51师团）第38军〈第2、第21、第55旅团，独立混成第34旅团〉,第3航空军（第5、第9飞行师团，第55航空师团）。

南方军总司令部一直存在到1947年年底，在此期间曾负责协助盟军指挥部遣返海外投降日军事宜。

战后审判

南方军的许多高级将领因战争罪行后来被国际军事法庭处以死刑，在被处绞刑的7名甲级战犯中，有4人曾在南方军中任职，他们是板垣征四郎，土肥原贤二，木村兵太郎（前缅甸方面军司令官）和武藤章（前14方面军参谋长）。其他被处决的高级将领还有山下奉文，本间雅晴等人。