内在膜蛋白(又称integral
protein 整合蛋白 、跨膜蛋白transmembrane protein)，部分或全部镶嵌在
细胞膜中或内外两侧，以非
极性氨基酸与脂双分子层的非极性
疏水区相互作用而结合在
质膜上的蛋白。
内在膜蛋白几乎都是完全穿过脂双层的蛋白，亲水部分暴露在膜的一侧或两侧表面；疏水区同脂双分子层的疏水尾部相互作用；整合蛋白所含疏水
氨基酸的成分较高。
跨膜蛋白可再分为单次跨膜、多次跨膜、
多亚基跨膜等。跨膜蛋白一般含25%～50%的α螺旋，也有
β-折叠，如线粒体外膜和细菌
质膜中的
孔蛋白