1987年2月,如皋军用机场改为军民两用,定名南通机场,开辟如皋(南通)至北京航线,使用安-24型客机,35客位,航程1.5小时。每周二、五2个航班。1988年5月,改用伊尔-18型客机,90客位,每周星期三1个航班。1990年9月后,改为每周一、四2个航班。是年,单程航班69航次,客运量3812人次,乘坐率61.4%。1993—1994年,航班一度停飞。1994年7月,复航,每周二、五2个航班,仍由如皋(南通)飞北京,飞机型号恢复为安-24型。1995年,航行96架次,载客3052人次,乘机率90.8%。1999年4月1日,再次停航。
1964年8月,如皋机场工程动工建设,全县抽调人力物力支援,1965年10月竣工。时机场为
军用机场。
1986年9月改为军民两用,建立
中国联合航空公司南通分公司,场内设候机室,建筑面积612平方米,室内装有5170型X光电子安全检查仪等设备。联航售票处分设
南通市和
如皋县民航招待所两处。
1987年初,中国联合航空公司增设北京至南通(
如皋)航线,1月27日试飞成功,3月7日上午,在如皋机场举行了南通至北京首航式。
当时,南通到北京机票550元,先用“安24”40客小型客机,后改为“伊尔18”90客飞机,也多次用“图154”140客机型飞行,8000米的巡航高度,可以看见地面上的构筑物,空中飞行95分钟,降北京南苑机场。周二、五两个航班。还开辟过南通至广东惠阳的航线,每周一、三两个航班。
1993年2月16日,中国联合航空公司南通分公司如皋--北京航班
复航。
在
南通兴东机场建成前,有一段时间曾经同时也作为
民用机场的。那时南通飞北京航班就是在磨头机场起飞和降落的,每周两班。