2018年7月，安徽省发布关于进一步加强基础科学研究的实施意见（以下简称《实施意见》）。其中，在2018年底之前，将设立“墨子量子科学基金”、“墨子量子奖”等基金和奖项，激励基础研究取得重大发现与突破。2019年4月26日，12位中外科学家获得我国首届“墨子量子奖”。同年9月18日，首届“墨子量子奖”颁奖典礼在安徽合肥举行。

为了激励基础研究取得重大发现与突破，安徽省将鼓励社会各方面出资设立“墨子量子科学基金”、“墨子量子奖”等面向基础研究的科学基金和奖项。按照时间安排，“墨子量子奖”在年底前有望诞生。

2018年由安徽省投资集团控股有限公司、安徽国元控股(集团)有限责任公司、合肥兴泰金融控股(集团)有限公司三家企业共同捐资成立了墨子量子科技基金会，设立了“墨子量子奖”。

在国际范围内奖励量子通信、量子计算、量子精密测量等领域取得杰出科技成果的科学家。

“墨子量子奖”的每位获奖者将获得人民币100万元(约15万美元)的奖金和一块黄金奖章。

《实施意见》明确，将建立完善符合基础研究特点和规律的评价机制，针对不同高校院所、研究类型实行分类评价，探索建立以创新质量和学术贡献为核心的评价机制，完善科技奖励等激励机制，提升科研人员荣誉感。建立鼓励创新、宽容失败的容错机制，鼓励科研人员大胆探索、挑战未知。

今后，安徽省将打造省科技资源共享服务平台，加强基础性、公益性的自然本底数据、种质、标本等科技基础条件资源收集，并建立健全省科研设施与仪器开放共享管理机制和后补助机制，更多科技基础设施、科学数据和仪器设备将向各类创新主体开放。

2019年4月26日，墨子量子科技基金会在中国科学技术大学公布2018年度、2019年度“墨子量子奖”获奖名单，12位中外科学家获得这一荣誉，每位获奖者将获得人民币100万元和一枚黄金奖章。

9月18日下午，首届“墨子量子奖”颁奖典礼在安徽合肥举行。中国科学技术大学常务副校长潘建伟等12位国际顶尖科学家成为2018年度和2019年度“墨子量子奖”获奖者。

2018年度“墨子量子奖”授予在量子计算领域做出杰出贡献的6位科学家，其中理论类的获奖人为Ignacio Cirac、David Deutsch、Peter Shor和Peter Zoller，表彰他们在提出了量子计算体系框架、量子算法和物理实现方面的开创性理论工作；实验类的获奖人为Rainer Blatt和David J. Wineland，表彰他们在基于囚禁离子实验探索量子计算方面的先驱性贡献。2019年度“墨子量子奖”授予在量子通信领域做出杰出贡献的6位科学家，其中理论类获奖人为Charles Bennett、Gilles Brassard、Artur Ekert和Stephen Wiesner，表彰他们在建立量子通信的理论框架方面做出的先驱性贡献；实验类的获奖人为Jian-Wei Pan（潘建伟）和Anton Zeilinger，表彰他们开创性的实验工作使具有现实安全的广域量子通信成为可能。

2019年度“墨子量子奖”授予在量子通信领域做出杰出贡献的6位科学家，其中理论类获奖人为Charles Bennett、Gilles Brassard、Artur Ekert和Stephen Wiesner，表彰他们在建立量子通信的理论框架方面做出的先驱性贡献；实验类的获奖人为Jian-Wei Pan(潘建伟)和Anton Zeilinger，表彰他们开创性的实验工作使具有现实安全的广域量子通信成为可能。

2020年度“墨子量子奖”获奖者卡尔顿·凯夫斯来自美国新墨西哥大学，凭借其“在量子精密测信息理论方面的基础性工作，尤其是阐明干涉仪中的基本噪声及其在压缩状态下的抑制作用方面的工作”获奖。来自日本东京大学的香取秀俊和来自美国科罗拉多大学博尔德分校的叶军，他们的获奖理由是“在量子精密测量方面的突破性成就，特别是在开发极其稳定和精确的光学原子钟方面的成就”。

2018年度的获奖者包括英国牛津大学教授戴维·多伊奇（David Deutsch）、美国麻省理工学院教授彼得·绍尔（Peter Shor）、德国马普量子光学所研究员伊格纳西奥·西拉克（Ignacio Cirac）、美国俄勒冈大学教授大卫·维因兰德（David Deutsch）、奥地利因斯布鲁克大学教授彼得·佐勒（Peter Zoller）和雷纳·布拉特（Rainer Blatt）。

2019年度的获奖者包括以色列学者史蒂芬·威斯纳（Stephen Wiesner）、美国国家科学院院士查尔斯·贝内特（Charles Bennett）、加拿大蒙特利尔大学教授吉勒斯·布拉萨德（Gilles Brassard）、英国牛津大学阿图尔·埃克特（Artur Ekert）、中国科学技术大学教授潘建伟和奥地利维也纳大学教授安东·塞林格（Anton Zeilinger）。

2020年度“墨子量子奖”获奖者名单：量子精密测量领域的科学家卡尔顿·凯夫斯（Carlton Caves）、香取秀俊（Hidetoshi Katori）和叶军（Jun Ye）。

2021年度“墨子量子奖”获奖者名单：加州大学伯克利分校教授约翰·克拉克（John Clarke）、耶鲁大学教授米歇尔·德沃雷（Michel H. Devoret）和日本理化学研究所教授中村泰信（Yasunobu Nakamura）。

2024年10月2日，墨子量子科技基金会消息，2023年度墨子量子奖授予量子通信领域两位杰出科学家：瑞士日内瓦大学教授尼古拉斯·吉辛（Nicolas Gisin）及英国布里斯托大学教授John Rarity，表彰他们在使用光纤进行早期量子密钥分发实验中的重要贡献。每位获奖者将获得人民币125 万元（税后约15万美元）的奖金。