《史记索隐序》是
唐朝史学家
司马贞为其创作的史学著作《
史记索隐》写的序文。《史记索隐》主要针对汉朝司马迁创作的通史
《史记》进行了注释和扩充，序文则介绍了《史记》的基本内容。
司马贞，字子正，唐河内（今沁阳）人。开元中官至朝散大夫，宏文馆学士，主管编纂、撰述和起草诏令等。唐代著名的史学家，著《史记索隐》三十卷，世号“小司马”。司马贞以《史记》旧注音义年远散失，乃
采摭南朝宋
徐广《史记音义》、
裴骃《
史记集解》、齐邹诞生《史记集注》、唐刘伯庄《
史记音义》、《史记地名》等诸家的注文，参阅
韦昭、贾逵、杜预、谯周等人的论著、
己见，撰成对后世很有影响的史学名著《史记索隐》，该书音义并重，注文翔实，对疏误缺略补正颇多，具有极高的史学研究价值，与南朝时期的宋国裴骃的《史记集解》、唐张守节的《史记正义》合称“
史记三家注”。后世史学家誉称该书“价值在裴、张两家之上”。
史记者，汉太史司马迁父子之所述也。迁自以承五百之运、继春秋而纂是史。其裹贬覈实，颇亚于丘明之书。于是上始轩辕，下讫天汉，作十二本纪、十表、八书、三十系家、七十列传，凡一百三十篇。
【考证】司马贞唐人，讳世作系，下文系本亦世本也，全文仿之。始变左氏之体。而年载悠邈，简册阙遗，勒成一家，其勤至矣。又其属橐，先据左氏《国语》、《系本》、《
战国策》、《楚汉春秋》及诸子百家之书，而后贯穿经传，驰骋古今，错综隐括，各使成一国一家之事。故其意难究详矣。比于《班书》，微为古质，故汉晋名贤，未知见重，所以魏文侯听古乐，则唯恐卧，【考证】事见礼乐记，史记乐书。良有以也。逮至晋末，有中散大夫东莞徐广，始考异同，作《音义》十三卷。宋外兵参军裴骃，又取经传训释作集解，合为八十卷，虽麤见微意，而未穷讨论。南齐轻车录事邹诞生，亦作《音义》三卷，音则微殊，义乃更略，而后其学中废。贞观中，谏议大夫崇贤馆学士刘伯庄，达学宏才，钩深探赜，又作《音义》二十卷，比于徐、邹，音则具矣，残文错节，异音微义，虽知独善，不见旁通。乾隆四年经史馆校刊本，音作旨。欲使后人从何准的，贞謏闻陋识，颇事钻研。而家传是书，不敢失坠，初欲改更舛错，裨补疏遗，义有未通，兼重注述。然以此书残缺虽多，实为古史。忽加穿凿，难允物情。今止探求异闻，采摭典故，解其所示解，申其所未申者，释文演注，又重述赞。凡三十卷，号曰《史记索隐》。虽未敢藏之书府，亦欲以贻厥孙谋云。
【考证】钱大昕曰：司马贞注高祖纪母曰刘媪云，近有人云母温氏。贞时打得班固泗水亭长古碑文，其字分明作温字，云母温氏，贞与贾膺复、徐彦博、魏奉古等执对反复，沈叹古人未闻。按膺复当作膺福，先天二年，为右散骑常侍昭文馆学士，以预太平公主逆谋诛。今河内县有大云寺碑，即膺福书也。徐彦博卒于开元二年，见《唐书》本传。而司马贞、张守节二人，《新》、《旧唐书》无传，守节《正义序》，称开元二十四年八月，杀青斯竟，而小司马两序则不载撰述年月。以此注验之，其与贾、徐诸人谈议，当在中睿之世，计其年辈，似在张守节之前，补《史记》序自题“国子博士弘文馆学士”。
唐制，弘文馆皆以他官兼领，五品以上为学士，六品以下曰直学士，国子博士，系正五品上，故得学士之称。神龙以后，避孝敬皇帝讳，或称昭文，或称修文。开元七年，仍为弘文，小司马充学士，盖在开元七年以后也。《唐书·刘知几传》：“开元初，尝议《孝经》郑氏学，非康成注，当以古文为正；《易》无子夏传；《老子书》无河上公注。请存王弼学。宰相朱璟等不然其论，奏与诸儒辨质，博士
司马贞等其黜其言，请二家兼行，唯子夏《
易传》请罢。诏可。”又考《唐艺文志》称“开元润州别驾，盖由弘文馆出为别驾，遂蹭蹬以死也。”