千日战争，1899年至1902年哥伦比亚保守党与哥伦比亚自由党之间进行的历时千余天的内战。

自从玻利瓦尔解放哥伦比亚后，联邦制和共和制便是反殖民统治者阵营中一个悬而不决的争论。而后新格拉纳达共和国分裂成三个国家。哥伦比亚成为其中一个。1863年哥伦比亚里奥内格罗宪法中规定哥是一个联邦制国家。这样各个党派之间就各自发展，拥有自己的军队，有时候非执政党的军队比国家的军队还要强大。所以联邦制中的极端主义者——中央集权派便着手修改1863年的宪法，企图在法律名义上压倒对手。

在国内外危机，以及零星的内战的刺激下，特别是宪法被修改后，各地高举自由主义的旗帜，反对新宪法，武装内战爆发。

1899年10月24日的马格达雷纳教区，也就是战争开始后的一段时间，自由党人便失败了。但是保守党人也被众多问题困扰着，内部分裂成历史主义者和民族主义者。双方各自推选出自己的总统候选人，但是依旧进行着残酷的战争。 战争的进程是血腥而又残酷的。哥伦比亚国民狂热的支持着某一方，但是两方花了大力气，却没有任何吃掉对方的可能性。佩拉隆索和帕洛内格罗（桑坦德）战役是其中最悲壮的两次战役。开始阶段，在乌里韦的带领下，自由党取得一些胜利。1900年5月25日，保守党军队在帕洛内格罗阻挡了自由党人的进攻，一场消耗战打响，其次悲壮的战斗是库库塔城包围战。

帕洛内格罗战役后，双方都觉得没有意义战斗下去了。自由党人孤立无援，资源缺乏，内部开始分裂成投降派和好战派。保守党人也想终止战争，所以到后来战争的烽烟渐渐散去，战区的地区仅仅位于巴拿马和加勒比海沿岸。

由于停战协议的生效，避免了一场国际战争。当时新的委内瑞拉总统支持乌里韦的自由党军队，并陈兵边境。政府军在此时切断了委内瑞拉到自由党军队的后勤补给线。这个时候乌里韦决定投降求和。

1902年10月24日，当巴拿马（当时还属于哥伦比亚）战火依旧猛烈之时，两个党派在加勒比沿岸哥伦比亚大沼泽附近的马格达雷纳香蕉种植区内埃尔兰迪亚庄园（hacienda Neerlandia ）中达成停火协议。

巴拿马的战事在美国总统西奥多·罗斯福的亲自关注下，为了保护巴拿马运河的开掘利益，美国海军不断在巴拿马附近海域游弋。巴拿马自由党人不得不放下武器。

1903年11月21日，美国威斯康辛战列舰上（Wisconsin）协议签署，哥伦比亚历史上最残酷的内战终于结束。

战争使得哥伦比亚满目疮痍，国力大减，国民分裂。最直接，最大的影响是国家分裂。1903年11月3日，巴拿马在美国的支持下，公然从哥伦比亚分裂出去，成为一个新的独立国家。

哥伦比亚在这次战争后，享有了半个世纪多的和平。1958年，两党之间再次爆发武装斗争，随后则是毒品战争的爆发。哥伦比亚游击队在政府军的不断清剿下，控制区域不断缩小，可哥国内还是暴力事件不断。

哥伦比亚国宝级作家、诺贝尔奖获得者马尔克斯在多部小说中提及了这场对哥历史，人民有着深远影响的战争。他的外公曾经是千日战争中的上校，所以在家庭生活的耳濡目染之下，对战争有着异乎寻常的灵敏感觉。

在马尔克斯的作品中，《百年孤独》中的大难不死的奥雷里奥-布恩蒂亚上校，《没有人给他写信的上校》中的等抚恤金的上校，《苦妓追忆录》中主人公的父亲就死在内埃尔兰迪亚条约签订之日死去，《霍乱时期的爱情》中费尔米娜随父亲在山道上的遇险等等，都或多或少跟这段历史有关。