北京大学附属小学石景山学校前身是石景山区六一小学。学校成立于1961年6月，原名北京军区六一小学直属工作队，1964年归属地方，更名为石景山区六一小学，2003年在石景山区教育结构布局调整中，与西下庄小学合并。2015年5月28日，经由北京市教工委、海淀区教委、石景山区教委共同推进，北京大学附属小学与“石景山区六一小学”进行深度合作办学。将原“石景山区六一小学”更名为“北京大学附属小学石景山学校”。学校已有34个班级，1080名学生，近百名教职员工。学校占地面积21982㎡，建筑面积11767㎡。 未来，学校将秉承北京大学“思想自由，兼容并包”的学术精神，形成“以人为本，快乐和谐发展”的办学理念以及“自由、民主、开放、包容”的办学特色。
六一小学于1961年6月1日在石景山区八大处龙泉寺建立，全名“中国人民解放军北京军区直属队六一小学”，1964年底学校迁移到现校址，并移交
北京市教育局，更名为“
北京市石景山区六一小学”。
1976至1986年，学校进入了制度化、规范化管理阶段，期间，召开了第一届教代会，讨论并通过了六一小学系列规章制度。内部管理的加强，规章制度的完善，使人人都按规范办事，事事都有制度可循，学校工作逐步走向有序、规范、稳定。1985至1990年，学校提出“全面发展，实现整体优化”的办学方针，教育教学处于石景山区领先地位。1988年起，大力开展美育活动，创办艺术节开始举办艺术节，浓厚的艺术教学氛围，使得学校在北京市舞蹈、合唱、电子乐队等各项比赛中遥遥领先。
1990至2000年，为配合教育教学改革，学校在石景山区率先引进现代化电教手段，建立“校园闭路系统”，探索“现代化教育媒体与传统教育手段相结合”的
课堂教学模式。
校园文化建设的加强，为学校今后发展奠定了坚实的基础。
进入新世纪以后，学校发展迅速，积极探索可持续教育教学模式，构建独具特色的“六一”校本课程体系，开创德育工作新格局，致力学生综合素质的培养，促进学生个性的发展。建构互动式3D无疆数字的校园，实现校内校外，学校家庭的和谐共振。