万人坑是外来侵略者对中国人民屠杀后处理尸体的一种方式。其中万人并不是具体的数字，而是表示数量众多的意思，坑则是挖坑掩埋的意思。今主要指日本帝国主义侵略我国，在各地屠杀我同胞后埋葬尸骨的地方。如旅顺大屠杀万人坑、南京大屠杀万人坑、庙儿沟“万人坑”等。

1894年，日本发动了侵略中国的“甲午战争”，清军败北。11月21日，日军侵占旅顺，攻城主将第一师团长山地元治便“下达了除妇女老幼以外全部消灭的命令”，随即开始了连续三日的大屠杀。实际上，妇女老幼并未被排除在外，而是挨家挨户搜查，见人就杀。“甘六日(公元11月23日)又复搜山至后面长墙以内及水师营大加杀戮”，“廿五、六搜山后，所杀兵民男女更多，民间牛羊鸡猪搜罗殆尽。”被杀害的中国人在郊外者陈尸荒野，“旅顺街道所杀民人…以大坑收埋”，这就是日军在辽宁留下的第一个“万人坑”，后由中国人民将其改称为“万忠墓”。据1948年重修万忠基时的调查，该“万人坑”埋有被害中国人18000余人。

1931年，日本发动了侵占东北的“九一八事变”。事变的发生，激起了中国人民的强烈反抗，抚顺平顶山“万人坑”，就是在抗日义勇军袭击抚顺后日军对平顶山居民大屠杀形成的。

平顶山位于抚顺市的东南郊，原是一个有约3000多人口的郊区村镇，居民由煤矿的矿工及其家属和当地农民、商贩等组成。1932年9月15日晚，抗日义勇军“辽宁民众自卫军”第11路军梁希夫部千余人经过平顶山一带袭入抚顺市区，突破日军的封锁，杀死了杨柏堡炭矿长渡边宽一、日本自卫团长平岛善作等七八个日本人，在腰截子、杨柏堡、老虎台、东乡等处捣毁了日本人经营的商店和发电所等煤矿设施，造成几个矿井停电、停产，给日本侵略者以沉重打击。袭击事件发生后的第二天早上，驻抚顺日军守备队长川上精一、宪兵分遣队长小川一郎、抚顺公署参事官山下满男等在小川的办公室开会，认为“大刀匪”是从平顶山方向来的，这里的老百姓没有报告，“统统‘通匪'”，“只有把他们全部烧光、杀光”上午11时许，日军包围了平顶山村，以给全体百姓“照相”为名，挨门挨户把人叫出来，用刺刀逼着将村民驱赶到西南沟的洼地里，随即用事先准备好的机关枪进行了一个多小时的大屠杀。枪声和百姓的哭叫声停息后，又用刺刀对尚在蠕动的人补刺了一遍方才离去。第二天，日军将被杀百姓的尸体集中到附近的土崖下用汽油焚烧，然后用炸药将土崖炸塌，掩盖住被烧的尸骨，形成了平顶山惨案“万人坑”。据1932年11月南京国民政府外交部就平顶山惨案向日本政府提出的抗议中所载，屠杀时未中要害者当夜逃出130余人，被杀害百姓达2700余人。在平顶山居民被害的第二天，日军又到与平顶山邻近的栗家沟、千金堡等村进行屠杀，又杀害了170多人。

辽宁的煤、铁、镁等各种资源丰富。日本侵略势力深入辽宁后，便施展各种手段，陆续把抚顺、本溪、鞍山、阜新等地的煤铁等矿产资源攫为己有，并利用中国的廉价劳动力进行开采。日本殖民者为了追求最大利润，采取了掠夺性的开采和“要矿不要人”的野蛮政策，采用童工、劳工和由战俘编成的“特殊工人”进行开采作业，加上恶劣的生产和生活条件，造成大批工人死亡，形成了一个个白骨累累的“万人坑”。

抚顺煤矿是日本在中国掠夺的最大的煤矿。自1905年日本侵入并新占抚顺煤矿后，在长达40年的时间里，共掠夺优质煤炭约22670多万吨，同时造成27万多人伤残，在茨沟、青草沟、南花园等地留下了30余处“万人坑”。

日本霸占抚顺煤矿后，为了更多地掠夺煤炭，不顾工人死活，设备经常失修，事故频繁发生，造成大批工人伤亡，这是形成“万人坑”的重要原因之一。1917年1月11日大山坑的瓦斯爆炸，许多工人被烧死、砸死。矿山当局为了保住矿井，逼迫工人用铁板、黄泥将井口封死，并派警卫队严密把守井口，致使被困在井下的1000多名工人除事先逃出的几名幸运者外，全部葬身火海。大火熄灭后，被烧得无法辨认的尸骨从井下捡出，被埋入一个大坑中。

1921年露天矿的大水，淹死中国工人400余人；1928.年4月大山坑南大井积水蔓延，造成472名中国工人死亡；而1931年2月7日大山坑的火灾，又造成约3000人的死亡。据不完全统计，自1907年至1931年，抚顺煤矿死亡和伤残的工人总数为176991人。九一八事变后抚顺煤矿的伤亡人数无连续统计，仅据1940年一份资料的统计，全年事故伤亡人数就达4423人。

1937年卢沟桥事变发生后，日本侵略军在关内作战中俘获的中国战俘，大部被日本押往东北各大煤铁矿山从事最繁重、最危险的劳动，成为日本掠夺我国矿产的重要劳动力资源，被称之为“特殊工人”。由于’特殊工人”的劳动强度大，而生活待遇最低，因此死亡率也最高。据抚顺日本宪兵分遣队特高系人员、战犯宝田震策供认：从1940年到1945年8月，在抚顺服苦役的“特殊工人”总数约4万人，除极少部分逃跑外，到1945年8月日本投降时只剩下七八千人，其余都惨遭杀害或劳累过度患病致死。由于这些“特殊工人”家在外地，死去的都被扔进了“万人坑”。

上述在抚顺煤矿发生的种种情况，在本溪的煤矿铁矿、阜新煤矿、北票煤矿、辽阳弓长岭铁矿、大石桥镁矿等矿山也同样存在着。本溪煤矿1942年4月26日的瓦斯大爆炸，一次就使1490多名矿工惨死在井内。日本在侵占本溪的14年中，仅在庙儿沟铁矿（现南芬露天矿）就掠夺性开采富矿石373.5万吨，贫矿石201.2万吨，造成17000余名工人死亡，形成了白骨累累的庙儿沟“万人坑”。在阜新，日伪从1936年设立“满洲炭矿会社阜新矿业所”，到1945年日本投降，在不到十年的时间里共掠夺煤炭1532万吨，造成约十万矿工死亡，留下了孙家湾南山、新邱兴隆沟、五龙南沟、城南等4处“满炭墓地”即“万人坑”，总计占地面积达50多万平方米。其中孙家湾南山基地占地20多万平方米，埋葬着3万多死难矿工。经发掘的一处长16米、宽2米的基坑中，层层叠叠地埋葬着83具尸骨0。在北票，日本在统治北票煤矿的12年中，共掠夺精煤近864万吨，造成31200余人死亡，形成了5个“万人坑”。其中，台吉南山“万人坑”占地1.7万平方米，除散落沟中的大量尸骨因多年雨水冲刷无从整理外，仅在山坡上就发掘清理出6500多具矿工的尸骨心。在辽阳的弓长岭铁矿，埋葬死亡矿工的三道沟就有“万人坑”和“千人沟”各一处。由于死难矿工太多，埋葬的地方有限，日本侵略者当局修建了炼人炉，用于火化死难矿工的尸体。南满矿业株式会社控制的大石桥镁矿，在七八年时间里，有18000多名矿工被折磨致死，形成了虎石沟、马蹄沟和三道沟三个“万人坑”。其中在虎石沟清理的不到140平方米的'万人坑”一角，就露出171具尸骨，上下叠压达7层。

1937年12月13日，南京最黑暗的一天。日军破城后，先后在太平门、江边、幕府山、汉中门、江东门、南京东郊等地大肆屠杀市民、放下武器的国民党官兵，一时间血雨腥风，尸首遍地，惨状触目惊心。日军在大批屠杀这批难民和俘虏以后，兽性没有收敛，又施行所谓的“良民登记”，继续搜捕放下武器的军人。

当年在金陵大学负责工程管理工作的毛德林回忆说：“当难民区将要解散时，在原金陵大学范围内，有两个尸骨坑，一个在天文台西面，是东西约十米、南北约三米的土沟，所埋尸骨不知是何处运来的，覆盖黄土约两米高：另一个在北京西路南侧，现南京大学木工厂东首，是约五米直径的圆土坑，覆盖约高三米。这个土墩在日伪统治时期就已经拉平。那时，我们都说它们是‘万人坑'。”

据世界红卍字会南京分会救济队掩埋组在1946年上报的统计表之二中写道：“1938年1月26日，在云南路西桥塘内收殓125具尸首，其中一具是女性，埋藏在金陵大学农场荒地：同年2月19日，在牯岭路及金陵大学等数十处收殓尸首672具，埋在阴阳营南秀村安义地，其中有小孩20具。同年2月27日，从三牌楼及妙乡等10余处收集尸首337具，埋在阴阳营北秀村安义地。”

1937年12月间，侵华日军在江东门集体屠杀了1万多名中国战俘及平民，遇难者尸体被慈善团体就地掩埋于“两个水塘和一条壕沟内”。1983年、1998年和2006 年，曾先后 3 次在此地发掘近千具遗骸，经史学、法医学、考古学等多学科鉴定，确认为南京大屠杀遇难者的骸骨。

从1998年4月至1999年12月，在江东门侵华日军南京大屠杀遇难同胞纪念馆（ 以下简作纪念馆） 内“万人坑”遗址，陆续清理发掘出208具南京大屠杀遇难者遗骨。第一阶段，1998年4月30日－7月24日，共发掘遗骨35具。第二阶段：1998年12月7日－22日，共发掘遗骨20具。第三阶段：1999年7月30日－12月6日，共发掘遗骨153具。

发掘现场也只是当年“万人坑”遗址的一部分。 考古专家认为，如果在周围继续发掘，一定会有新的发现。 但受到纪念馆建筑布局等因素的限制，不得不中止“万人坑”遗址外延的发掘工作。

在发掘的同时，纪念馆协调有关部门，对遗骨进行了考证。 为弄清发掘现场原始的地形、地貌、遗骨掩埋范围等一系列问题，考古工作者每挖一具遗骨均详细地做好文字记录、绘出图例、拍摄录像和照片，留下了一套完整真实的发掘资料。南京市公安局刑事科学技术研究所的法医运用法医学原理和技术，多次到现场进行勘察鉴定，留下了一套科学可信的“物证鉴定书”。纪念馆组织部分专家学者查找历史资料，走访有关证人。 先后找到了红十字会、崇善堂埋尸记录等5份档案资料，基本弄清了当年在江东门一带共有5万多具遇难者尸体被掩埋，而仅在江东门这一地点埋尸就达1万余具的史实。 此外，除已知目睹江东门屠杀和尸体掩埋的11位证人外，又发现了5位新的证人。 考古、法医和史学专家从不同的角度，对发掘遗骨的特征、性质进行了科学、客观的分析和考证。

发掘现场出土的遗物中有：遇难者衣服特别是儿童“虎头帽”上的饰物铜纽扣54颗，遇难者随身携带的铜质方孔圆钱73枚，遇难者中女性佩戴的饰物铜簪3根以及断刀、瓷碗等。特别值得注意的是与遗骨处于同一层面位置上，发现了3颗子弹壳，1颗子弹头，这说明侵华日军曾在这一现场屠杀过中国军民。家住江东门中保村的幸存者陈德星，在1937年12月路过江东门时曾亲眼看到：“日本兵在模范监狱前面把桌子、床板、大门板、木料等堆在一个坑内，倒上汽油点燃，然后两个日本兵架着一个中国人，后面一个日本兵用刺刀戳着中国人的脊背，随后把中国人往火里推，只听到声声惨叫，实在惨不忍睹。”

根据遗骨的腐败崩解等情况，结合有关实验室检验，并参考了中国医科大学贾静涛教授主编的《法医人类学》第十章有关内容，还参考了日本北海道大学锡谷彻教授主编的《法医诊断学》第三章有关内容综合分析，结论是遗骨埋葬时间距检验时间为60年左右。据史料记载和幸存者回忆，慈善机构曾于1938年初在此掩埋，到1998年－1999年，其间正好是60年左右。综上所述，我们可以断定，该处遗骨就是当年被侵华日军杀害的南京大屠杀死难者的遗骨。

此外，南京还有多处万人坑遗址。仅就雨花台区一个地区而言，就有上新河、螺丝桥二道桥口、棉花堤等处，其中最著名的当数江东门和普德寺两处万人坑。普德寺的万人坑，则是在不同地方的遇难者，由红卐字会先后移来掩埋，是处丛葬地。该会每一次掩埋，均有详细记录。故为一处有确实数字，名副其实的万人坑。

为悼念南京大屠杀遇难同胞，启迪后人牢记历史、珍爱和平，1985年8月15日侵华日军南京大屠杀遇难同胞纪念馆正式建成开放。侵华日军南京大屠杀遇难同胞纪念馆位于江苏省南京市建邺区水西门大街418号，建立在南京大屠杀江东门集体屠杀场地及“万人坑”遗址之上，是一座纪念性的遗址型历史博物馆。后经1994年至1995年、2005年至2007年两次扩建，现占地面积约7.4万平方米，建筑面积2.5万平方米，展陈面积1.2万平方米。新馆于2007年12月13日南京大屠杀70周年之际建成开放，分展览集会区、遗址悼念区、和平公园区、馆藏交流区4个功能性区域。现有藏品15万余件，文物1.5万余件。馆内展示了 3500 多幅历史照片、3300 多件历史文物、149 部历史影像资料片、12800盒南京大屠杀遇难者和幸存者档案，综合运用了场景复原、声光电等现代科技展陈手段，使整个展览场景逼真，令人震撼。