鞭毛运动指依靠鞭毛进行的的主动性运动。一些细菌的鞭毛粗细约为10-35纳米，借助它的运动使细菌获得推动力。

一般是许多鞭毛成束地运动，用暗视野照明的显微镜可以观察到。运动类型有螺旋状波动和圆锥状旋转两种，通常伴有菌体的反向旋转。前者运动类型，是通过改变鞭毛的方向来改变前进方向，后者则是通过改变旋转方向来改变前进方向的。关于鞭毛运动的机理，有的认为是由于鞭毛结构蛋白质鞭毛蛋白的排列发生改变造成的，有的则认为是由于鞭毛和菌体在类似轴承的接合部位发生相对旋转引起的

真核细胞的鞭毛粗细约为0.2微米，有平面波动、立体波动（螺旋状运动等）、浆式运动（纤毛摆动）等三大运动类型，有时同一种鞭毛也可以有几种运动类型。例如衣藻（Chlamydomonas）靠2条鞭毛平面游动（即平面波动）前进，而靠立体波动后退。鞭毛运动不仅可使微小个体游动，而且是与摄食、消化、排泄有关的体内外各种流动的原动力，如海绵动物的领细胞、腔肠动物的内皮细胞、轮虫动物的焰细胞、环节动物的有管细胞等都有这种鞭毛运动。真核细胞的鞭毛内部结构与纤毛相同，看来运动机理也基本相同。

在某些菌体上附有细长并呈波状弯曲的丝状物，少则1-2根，多则可达数百根。这些丝状物称为鞭毛，是细菌的运动器官。

从一些原核细胞和真核细胞表面伸出的、能运动的突起。鞭毛较长，数目少；纤毛与鞭毛有相同的结构，但较短，数目多。细菌的鞭毛则有完全不同的结构。

鞭毛一般长约150微米，纤毛5～10微米，两者直径相近，为0.01～0.03微米。大多数动物和植物的精子都有鞭毛。精子及许多原生动物都以鞭毛或纤毛为运动器。

具有鞭毛的细菌大多是弧菌、杆菌和个别球菌。

纤毛和鞭毛由3个主要部分组成：中央轴纤丝、围绕它的质膜和一些细胞质。轴纤丝从纤毛或鞭毛底部的基粒直达顶端，为一束直径约220～240埃的微管，在基粒底部，则集聚成圆锥形束，深入到细胞质中。

轴纤丝横切面的微管排列是9+2式，即中心有一对由中央鞘包裹着的微管，外围环绕以两两连接在一起的9组微管二联体。

基粒的结构象中心粒一样是9+0型，但它的9组微管是三联体。纤毛或鞭毛二联体中的微管，就是从基粒三联体中两根微管延伸出来的。

鞭毛和纤毛的运动是由于它们局部弯曲，从基部向顶端波浪式地推进的结果。由于微管二联体的长度不变，推测这种局部弯曲是由于相邻的两根微管二联体沿长轴滑动引起的。局部滑动所需的能量是由ATP周期性水解提供的。

细菌鞭毛的结构和化学成分都与真核细胞的鞭毛完全不同，不存在9+2的微管型式，而是由2～5条，宽约40～50埃的微丝组成，其蛋白质成分是鞭毛蛋白。除螺旋体外，其他细菌的鞭毛都没有质膜包被。虽然它们的基底也深入到原生质内的颗粒中，但这种颗粒与基粒毫无相似之处。细菌鞭毛运动的能源不是ATP，据认为是来源于细胞膜的电子传递系统产生的一种电化学梯度。

分类：根据鞭毛的数量和部位，可见鞭毛菌分为四类。

化学成分：蛋白质.鞭毛蛋白具有较强的抗原性，可藉此进行细菌的鉴定和分型。

结构：鞭毛自细胞膜长出，游离于菌细胞外，有基础小体、钩状体和丝状体三部分组成。

功能：鞭毛是细菌的运动器官。鞭毛菌在液体环境下可自由移动，速度迅速。

1. 化学趋向性运动，有助于细菌向营养物质处前进，而逃离有害物质.

2. 与细菌致病性相关

3. 可用以细菌的鉴定和分类

应用

①鉴别细菌

②分血清型.

各种不同类型的鞭毛

细菌鞭毛

不同种类的细菌有不同的数目的鞭毛。Monotrichous细菌有一个单一的鞭毛（如霍乱弧菌 ）。 Lophotrichous细菌有多种鞭毛设在细菌同样的表面上，而协调一致地行动，将细菌进往单一的方向前进。

一些细菌，如selenomonas ，鞭毛是有组织外胞体。

古菌鞭毛

古菌鞭毛，表面看起来类似细菌（或 Eubacterial）鞭毛。

1990年代曾发现了许多古菌和细菌鞭毛详细的分歧，其中包括：

细菌鞭毛是由一个流动的 H + 离子，古鞭毛几乎肯定由腺苷三磷酸[ATP]。

细菌细胞中往往有许多鞭毛的细丝，古鞭毛由许多长丝组成一捆。

真核生物鞭毛

真核鞭毛是完全不同于其它从原核生物鞭毛在结构和进化起源。