长江上游经济研究中心是在
重庆工商大学区域经济研究院的基础上，经过整合于2002年9月正式成立，其前身是1993年建立的
重庆商学院经济研究所。它由重庆市一批知名专家教授和学者为骨干而创建的专门学术研究机构。其任务和目标是：“组织协调全校理、工、管、文多学科的专家，通过承接科研课题、科研合作和开展学术交流活动等形式，主要立足重庆
直辖市和长江上游地区经济发展的重大现实问题进行多层次、系统性、综合性的理论与政策研究，为重大决策提供科学依据。”
本中心成立以来，本着
重庆工商大学“明德、博学、求实、创新”的办学思路，在各级政府的领导下以及所属各部门、相关企业的大力支持下，在人员少、开拓任务重的情况下，经过研究中心的内外专家的共同努力，中心在参与地方经济发展规划、社会热点问题研究、提供决策咨询、加强对外合作、丰富教学科研内容等方面取得了较好的社会效益, 打开了新领域，扩大了学校的综合研究声誉，基本实现了任务目标，并为今后的工作打下了坚实基础。
近三年来，中心坚持科研改革的方向，建立了知识创新机制，在应用研究的基础上，丰富了区域经济发展理论；以
西部大开发——长江上游经济发展——重庆经济发展——
三峡库区可持续发展为主线，形成了前后联系紧密，研究范围广泛，重点突出的研究体系；同时实现了区域经济学、产业经济学、城市经济学和资源经济学等多学科的合作与结合，增强了研究得科学性和实效性。近三年来，共承担国家、省部和市级各类课题120项，获得省部级科研成果奖励16项，发表论文228篇，出版学术专著18 部。已在三峡库区经济发展、
长江上游地区产业结构调整及产业发展和城镇化研究方面形成特色和较大研究优势。取得了丰硕的研究成果。为支持地方经济发展、为领导和政府部门的管理与决策作出了重大贡献，受到社会的广泛好评。
中心现有专职研究人员19人，其中教授14人，
副教授5人；具有硕士、博士学位15人；国家有突出贡献专家1人；省部级突出贡献专家1人；享受国务院
特殊津贴专家4人；重庆市
学术带头人5人；后备人选2人。科研力量比较好，人才队伍结构比较合理。
2002年9月 区域经济研究院经过整合，成立
重庆工商大学长江上游经济研究中心。中心设置三个子机构：三峡库区经济发展研究所、长江上游产业经济研究所、长江上游城市经济研究所。王崇举任中心主任，曾庆均任中心副主任。
2004年5月 重庆工商大学长江上游经济研究中心申报
教育部人文社会科学重点研究基地