邓仲元墓位于先烈中路79号黄花岗公园内七十二烈士墓东南侧。黄花岗七十二烈士陵园初建于1912 年，有规定不得附葬，但有感于邓仲元在辛亥革命建功甚巨，孙中山特准邓仲元墓设于陵园之内。1923年3月23日，邓仲元死难一周年，国民党广东支部全体成员赴黄花岗致祭，由孙中山代表朱培德主祭。次年6 月，孙中山亲书墓碣。
墓园内青松翠柏，互相辉映，蔚为壮观。墓道门楼面阔三开间，两边有厢房，是仿西方古典建筑风格的砖木结构建筑。正面中间的门洞两旁有方形倚柱和圆形旋柱各两根，是仿希腊的科林斯柱式，柱头混线变化多样，柱础线脚简洁，旋柱支撑旋拱的门洞，门楼正上部的山花有“邓仲元先生墓道”字样。门楼两侧有围墙50多米。
墓门后约400平方米的祭场，其右侧有邓氏铜像和八角亭，铜像原置广九车站门前邓氏被刺牺牲处，20世纪50年代初移置到这里。铜像中的邓仲元身穿军大衣，头戴人沿军帽，右手叉腰，左手握军刀，再现了陆军上将的英姿。八角亭是混凝土结构，绿琉璃瓦，八角攒尖顶。祭台右侧设乐台。
墓亭后是柱式纪念性建筑的墓表，高约15米，柱身有凹槽，柱座四面镶有青石，镌刻
胡汉民撰、
陈融书的《陆军上将邓仲元墓表》。祭场左侧为邓氏夫人李顺春及其子邓伟东墓。1983年8月，
广州市人民政府公布为市级文物保护单位。
缅怀革命先烈，保护烈士纪念设施是对牺牲英烈的深情礼赞，更是对中华民族精神的守护与延续。2023年，黄花岗公园投入约百万元资金对邓仲元墓区进行全面修缮，墓道门楼、铜像、乐台、八角亭、墓冢和墓表细致还原当年风采，以古韵新颜迎接每一位来园缅怀拜祭烈士的游客市民。
邓仲元(邓铿)于1885年12月27日出生，7岁时随父亲到惠州市惠阳区淡水镇经商落户。1905年考入广州将弁学堂步兵科，1909年任黄埔陆军小学堂学长。1901年筹划广州起义。辛亥革命爆发后，是光复惠州的功臣之一，并创建了粤军第一师，邓演达、叶挺等著名将领均出自其门下。1914年后，一直是孙中山的得力助手，打了无数的硬仗。1917年，援闽粤战成立，邓仲元任粤军总部参谋长。1921年5月，任广州军政府第一师师长兼总司令部参谋长。1922年3月21日傍晚7时被枪杀，23日4时不幸逝世。卒年仅36岁。邓仲元逝世后，被孙中山追赠为陆军上将，葬于黄花岗七十二烈士墓之侧。邓仲元之死在广东引起了巨大震动，许多城市都有举行了悼念活动。广东都督胡汉民在1935年追忆邓仲元时曾说过一句话：“总理革命数十年，直接奉命为主义前趋之军人，当推仲元先生为第一人。”1935年，民国当局决议，在革命纪念日简明内增订3月23日为“
先烈邓仲元先生殉国纪念日”。新中国成立后，中央人民政府追认邓仲元为革命烈士。现惠州建有仲元亭、广州番禺的广东仲元中学以示纪念。