运输工务司（葡文：Secretaria para os Transportes e Obras Públicas）是中华人民共和国澳门特别行政区政府负责制定运输工务范畴政策和监督与该范畴有关的政府部门的实体，其司长为中华人民共和国澳门特别行政区政府的主要官员，由行政长官提名，经中华人民共和国中央人民政府任命。

输工务司的职能包括以下的项目：

土地事务； 交通管理及航空器和港务； 基础建设及公共工程； 运输及通讯； 环境保护； 房屋事务； 气象。