辅基（Prosthetic group）是酶的辅助因子，辅助因子还包括辅酶（coenzyme）和金属离子。

酶的辅助因子包括辅酶（coenzyme）、辅基（prosthetic group）和金属离子。辅酶专指那些与酶蛋白的结合比较疏松，可以用透析或超滤的方法除去的有机小分子；辅基专指那些与脱辅酶结合紧密、使用透析或者超滤的方法难以去除的有机小分子。在酶促反应中，辅酶作为底物接受质子或基团后离开酶蛋白，参与另一酶促反应并将其所携带的质子或基团转移出去，或者相反。辅基与酶蛋白结合较为紧密，不能通过透析或超滤的方法除去。在酶促反应中，辅基不能离开酶蛋白。金属离子是最常见的辅助因子，约2/3的酶含有金属离子。作为酶的辅助因子，最常见的金属离子有K+、Na+、Mg2+、Cu2+/Cu+、Zn2+、Fe2+/Fe3+等。

酶的辅因子或结合蛋白质的非蛋白部分（其中较小的非蛋白质部分称辅基），与酶或蛋白质结合的非常紧密，用透析法不能除去。按照化学组成，酶可以分为简单蛋白质和结合蛋白质两大类。胃蛋白酶、核糖核酸酶等一般水解酶属于简单蛋白质，这些酶只由氨基酸组成，此外不含其它成分。转氨酶、乳酸脱氢酶及其他氧化还原酶等均属于结合蛋白质。这些酶除了蛋白质组分外，还含有一对热稳定的非蛋白的小分子物质，前者称为酶蛋白，后者称为辅因子。酶蛋白与辅因子单独存在时，一般无催化能力，只有二者结合成完整的分子时，才具有活力，此完整的酶分子称为全酶。

例如：如全酶包括酶蛋白质和辅基（或辅酶）二部分，辅基与酶蛋白结合较牢固。辅基可以是有机化合物，如糖类、脂肪和核酸；也可以是金属离子或金属配位化合物，如铜（Ⅱ）是铜蓝蛋白的辅基，血红素是血红蛋白的辅基等。

因为辅基是与脱辅酶共价结合的有机小分子，所以用透析法不能除去。辅基在整个酶促反应过程中始终与酶的特定部位结合。例如细胞色素氧化酶的铁卟啉。