转录激活蛋白因子是能与启动子中特定DNA序列结合并激活基因转录反应的蛋白质分子。细菌
RNA聚合酶通过σ因子来达到识别基因的目的，其中很多应激反应基因依赖于σ54因子，它们能和启动子DNA结合形成一个稳定的
封闭复合物，这对于转录过程很重要。转录的开始需要结合于转录起始位点上游的激活蛋白驱动的
ATP水解。
开始需要将一种包含
RNA聚合酶（RNApolymeraseRNAP）以及双链启动子DNA的封闭启动子复合物转变为开放型复合物，因为只有发生这一过程，生物酶才能与单链形式的DNA模板发生作用。而细菌RNAP和主要的σ因子σ54形成的复合物是封闭型的，只有通过依赖于
ATP水解的激活蛋白重塑作用，它们才能变为开放复合物。