着生在细菌细胞表面的丝状运动器官。直径12～25nm，长3～12μm，柔软、波形。鞭毛按其着生位置可分单生(一根鞭毛着生于一端)、丛生(一丛鞭毛着生于一端或两端)和周生(多根鞭毛遍布于菌体上)。鞭毛数量和着生方式依细菌种类而异，它是细菌分类鉴定的重要形态特征。

着生在细菌细胞表面的丝状运动器官。直径12～25nm，长3～12μm，柔软、波形。鞭毛按其着生位置可分单生(一根鞭毛着生于一端)、丛生(一丛鞭毛着生于一端或两端)和周生(多根鞭毛遍布于菌体上)。鞭毛数量和着生方式依细菌种类而异，它是细菌分类鉴定的重要形态特征。

鞭毛不能直接用光学显微镜观察，需用鞭毛染色法使鞭毛与媒染剂结合加粗着色后，才可观察其形状和着生情况。电镜研究发现鞭毛，包括鞭毛丝、鞭毛钩和基体三部分。鞭毛丝为一中空的细丝，由分子量为15000～40000的球状鞭毛蛋白亚基螺旋排列而成，每一横切面包括8～11个亚基。鞭毛蛋白与动物肌纤维相似，有收缩性能，可借以运动。

鞭毛在菌体内的基部是鞭毛钩，它是鞭毛丝与基体的连接部位。基体位于细胞壁和质膜之间，鞭毛由质膜上代谢的酶类释放的能量驱动，并以协调配合的旋转推动细胞游动。其相对速度大于任何真核生物，可达其自身长度的10倍以上。有鞭毛的细菌能借鞭毛的主动运动实现趋化也主动趋向营养物质或避开有害化学物质。鞭毛常具有与菌体表面不同的特殊抗原成分，称为H抗原，在细菌分类鉴定上常用于血清型的划分。