谷子粒黑穗病主要为害穗部，通常一穗上只有少数籽粒受害。抽穗前不易发现，较难识别。病穗刚抽出时，因孢子堆外有子房壁及颖片掩盖不易发现。病穗短，直立，大部分或全部子房被冬孢子取代。当孢子堆成熟后全部变黑才显症。病粒较健粒略大或相等。颖片破裂、子房壁膜破裂后散出黑粉，即病原菌冬孢子。

该菌孢子堆可产生在寄主各个部位，多生于子房内，成熟后呈粉状，有的呈胶合状，深褐色至褐色。小穗大部分被毁坏为黑粉，颖片和子房壁渐变白色。孢子堆球形至卵圆形，大小2～4mm。冬孢子红褐色至榄褐色，球形或近球形至多角形，表面平滑，大小7～12μm。该菌不经休眠即可萌发，萌芽时产生先菌丝，不产生担孢子。萌发适温20～25℃。

该病属芽期侵染的系统性病害。冬孢子附着在种子表面越冬，成为翌年初侵染源。

种子萌发时，病菌的双核菌丝主要从幼苗的胚芽鞘侵入，并扩展到生长点，随寄主发育不断扩展，最后侵入穗部，破坏子房，致病穗上籽粒变成黑粉。

（1）选用抗病品种如龙谷28，鲁谷7号、8号，秦谷5号，赤谷4号，内谷5号，晋谷25号，冀谷11号，晋谷16号，公谷62号，九谷7号等。

（2）严格选种，剔除病穗并销毁。

（3）药剂防治用40%拌种双粉剂按种子量0.%～0.3%拌种或用50%多菌灵可湿性粉剂、50%甲基硫菌灵可湿性粉剂、15%三唑醇拌种剂、75%萎福双可湿性粉剂按种子量0.2%拌种，效果很好。