洪武十九年（1386）四月，议籍四方工匠，验其丁力，定三年为班，轮流赴京，每三月接替一次，名曰“输班匠”（“
轮班匠”）。未及实施，秦逵议量地远近为班次，置籍，为
勘合付之，至期赍至
工部，免其家
徭役，著为令。七月，明太祖念秦逵辛劳，诏
有司复其家。
洪武二十年（1387）正月，明太祖谓秦逵说：“
春秋之世，
人纪废坏，
孔子以
至圣之资，删述
六经，使先王之道晦而复明，万世有赖，功莫大焉。夫食菜则思树艺之原，衣帛则思养蚕之始，重其所从出也。孔子之功，与天地并立，故朕命天下通祀以致崇报之意，而
阙里又启圣降神之地，庙宇废而不修，将何以妥神灵、昭来世，尔工部其即为修理，以副朕怀。”
洪武二十二年（1389），进
工部尚书。五月，明太祖以古帝王庙地界
通衢，亵而不严，乃徙建于钦天山（今
鸡笼山）之阳，秦逵该月上奏庙已功成，自
三皇五帝，继以
三代、
两汉、唐、宋元勋硕德齐等者列像于庭，衮冕辉煌，明太祖嘉奖之。
洪武二十三年（1390）五月，诏各衙门掌印官更署，改任
兵部尚书。不久，复改工部尚书。十月，秦逵因各处弓箭岁造不便，奏准令工匠轮班赴京岁造。
洪武二十四年（1391）冬十月，明太祖以学校为国储材，而士子
巾服无异
胥吏，宜更易之。命秦逵制定
制式以进。经过三次修改，其制始定。赐监生蓝衫、绦各一，以为天下先。秦逵创造了明代
士子衣冠的标准。