1916年入蓬安县平头乡静圣庵读书，1920年进入蓬安县高等小学堂第15班学习，1926年（民国15年）毕业后升入师范班。1929年秋毕业，教了半年小学后，考入成都大学（
四川大学前身）理科预科学习。 1932年秋，预科学习期满后，进入生物系学习。因生活无着，1933年回蓬安，任县立初级中学教员一年。1934年，赴南京报考“
中央大学”，但为生活计，后报考
国民政府军事委员会“军事交通队”，在江西
星子县受训学无线电。1938年毕业，分配到成都国际无线电台实习。他觉得“搞无线电枯燥无味，不能发挥自己的特长”，在好友王绍先的介绍下，认识了
张怡荪先生，进入西陲文化院，从此即开始他的藏学研究生涯。由于他天资聪慧、博闻强记，加以学习勤奋，进步很快，不久即成为文化院的骨干和灵魂人物。《藏汉大辞典资料本》中积累的中外资料，大部分是他整理和翻译的，他对大辞典的体例设计、内容取舍、译文翻译等都起到了主导作用。他对藏族的传统文化——“五明之学”有深入的研究，是难得的“藏学通”。
1950年后，祝维翰在
拉萨参加革命，先执教于拉萨小学，后任职于西藏军区编审委员会，担任过《
西藏日报》编译室秘书和校审室副主任。在50年代前期，他对汉藏文翻译工作，特别是汉文藏译的新词术语，作出了不少开创性的贡献。1959年，调西藏文管会工作，后又担任自治区人委办公厅编译室副主任。1982年，调
西藏社会科学院工作。从1962年开始，他即抽调到成都，专事《藏汉大辞典》的编纂工作。1966年7月，“
文化大革命”开始后，编纂工作无法进行，他回到西藏原单位。1970年，被原单位送回家乡蓬安劳动。1974年，被《藏汉大辞典》编写组借到成都，为《藏汉大辞典》恢复编写作准备工作。1978年，《藏汉大辞典》经
邓小平、
方毅、
乌兰夫批示后恢复编写，重新成立编写组，祝维翰再次被任命为《大辞典》的副主编。
祝维翰逝世后，1983年4月20日，《藏汉大辞典》编纂组特给中共
蓬安县委宣传部致信说：“我组所编《藏汉大辞典》系邓小平同志亲自批示的一项重要科学研究工作。辞典主编、副主编，均由中央有关部门直接任命。贵县祝维翰同志是由国家民委和国家出版局任命的副主编，四十多年来他为这部辞典呕心沥血，成绩卓著。……我《藏汉大辞典》编纂组，为了表彰他对辞典做出的卓越贡献，拟在贵县平头公社祝维翰同志的家乡，用藏汉文立一石碑，以表纪念。”同时指出：“祝维翰同志一生，从事
西藏文化的研究，是一位造诣颇深的藏学专家，他在藏学方面的成就，在国内、外都有一定的影响”，“我们为贵县出了这样一位学者，感到高兴”。