碧洞宗为全真道龙门派的支派 。 清朝康熙年间龙门派道士陈清觉所创 。陈为湖北武昌人 ， 曾在武当山太子坡投师於全真道士詹太林 ， 后入川在青城山传道 。康熙皇帝诏见 ，敕封为碧洞真人，并赐 御书“碧洞丹台” 匾 、赤龙黑虎诗章等物。从此开创全真道龙门派碧洞宗 ， 对四川道教影响很大 。青城山、青羊宫的道士都属此派 。

碧洞宗传播于四川。据《龙门正宗碧洞堂上支谱》载，陈清觉，道号赛松，又号烟霞，湖北武昌人。少年为进士，入庶常。后辞官入道，至武当山太子坡拜龙门道士詹太林为师，为龙门派第十代弟子。

清康熙八年（1669）入川（或谓康熙二十六年入川），至青城山天师，修葺殿宇，潜心修道。

康熙二十六年（1687），将教务交张清湖，去成都青羊宫养静。臬宪赵良壁遇之，事以师礼，于青羊宫旁建二仙庵以居之。

康熙四十一年（1702），皇帝赐封“碧洞真人”号，并钦赐“碧洞丹台”匾额。康熙四十四年（1705）卒。传有弟子陈一庆、吉一法、刘一贞、孟一贵、石一含、龙一泉等。其住青城山之师弟张清湖、张清仕，住三台云台观之师弟张青云等亦各传有弟子多人。这些弟子再递相传授，逐渐形成一个支派，尊陈清觉为开派祖师，以其碧洞真人号之“碧洞”二字名宗，称碧洞宗。成为清至民国间对四川道教影响很大的一个宗派。碧洞宗依龙虎派所订派字传代。

其开祖陈清觉为第十代，依次相传，至民国时，已至第二十三代。

《龙门正宗碧洞堂上支谱》记有第十一至二十三代道士之名。第十一代有陈一庆等二十八人，第十二代有王阳炳等三十七人，第十三代有吴来辉等四十三人，第十四代有万复证等五十五人，第十五代有万本圆等一百人，第十六代有李合邦等一百二十八人（以下各代略）。所记是否为该派道士全部，已难知晓，仅此亦可概见其规模。碧洞宗以成都二仙庵和青城山天师洞为传播中心，逐渐向四川其他州县发展，上引《支谱》即记有该派道士住持之州县宫观名，统计宫观所在州县有：华阳、双流、温州、郫县、汉州（今广汉）、崇庆、灌县、大邑、彭县、潼川（今三台）、中江、绵竹、眉山、蒲江、邛州（今邛崃）、资阳、乐至、富顺、茂州（今茂汶）、汶川、天全、雷波等。上述州县，大都在川西地区，少数在川北、川南及少数民族地区。长期以来，四川各地道教皆属天师正一道，碧洞宗产生后，渐有取代他派的趋势。现代，青城山和成都青羊宫已全为龙门碧洞宗道士，正一道士只零星散居于其他宫观。碧洞宗在长期发展中，曾出现一些杰出道士。如第十三代王来通，号自明道人，清乾隆间住持灌县二王庙。他除整饬庙规，勤于教务外，又关心地方水利建设，发起新修横山长同堰，推广都江堰治水经验。他主持刊印的《灌江备考》、《灌江定考》、《汇集实录》三书，是现存都江堰治水经验总结的专书，有一定科学价值。第十四代陈复慧，号仲远，住持温州盘龙寺。博学能文，有《雅宜集》行世。对道教斋醮音乐颇有造诣，曾校正《广成仪制》数十种传世。被后世尊称为道教音乐“广成韵”之祖。

第二十二代易心莹（法名易理轮），是近代著名道教学者，著有《道学系统表》，辑有《女子道教丛书》等。

清康熙八年，湖北武当山太子坡一位叫陈清觉的道士来到了四川青城山。当时，青城山这座道教名山历经了明末的战乱，整座青城早已是道观毁损八九，道众逃散大半。陈清觉来到青城山后，招集道众，修桥铺路，重兴法事，重振玄坛。经过十多年的艰辛创业，使青城山又逐步恢复了道家仙山的风貌。

陈清觉，湖北武昌人，号烟霞子。少年习儒学，登第入庶常，除东宫侍讲。明末世道多乱，他辞官隐居，后来在武当山太子坡拜龙门派道士詹太林为师，出家修道。

1669年，陈清觉与师弟张清湖来到青城山，他留居天师洞，张清湖住文昌宫。当时的常道观殿宇毁坏，其情况如1726年的《常道铸钟铭》所记：“张贼兵燹常住，钟磬尽毁。幸而国朝升定，康熙八年稍有复旧。”经过陈清觉等人的共同努力，青城山面貌为之一新。康熙二十六年，陈清觉将青城山庙务一并交与师弟管理，单身来到成都青羊宫结茅静养。1695年，四川按察使赵良璧来到青羊宫，见陈清觉道貌奇伟，谈吐不凡，不禁感叹道：道长不是平常人，有出世之姿。后来，赵良璧出面购地建了二仙庵，迎请陈清觉主持。后来，赵良璧又将陈清觉事迹上奏了朝廷。康熙四十一年，陈清觉奉诏进京，得到了康熙帝的接见。康熙帝敕封陈清觉为“碧洞真人”，还亲笔书写了“丹台碧洞”匾额。从这个时候起，全真教龙门派碧洞宗诞生了，数百年来绵绵不绝，传承至今。