石首鱼是鲈形目石首鱼科鱼类，又名黄花鱼、江鱼。体侧上半部为黄褐色，下半部为金黄色，体侧有许多发光的小颗粒。因为其出水能叫，夜间发光，头中有像棋子的石头，所以叫石首鱼。
1．叫姑鱼属和湾（鱼或）属聚类成叫姑鱼亚科，支持国内学者认为该亚科与石首鱼类其他类群亲缘关系较远的观点。叫姑鱼属种间遗传距离大于同科其他属鱼类的种间遗传距离，表明叫姑鱼属较为原始，种间分化早。
2．白姑鱼亚科并非单系。黄姑鱼和
浅色黄姑鱼是姐妹群，但与“
鮸状黄姑鱼”和
双棘原黄姑鱼分处系统树的不同分支。中国双棘原黄姑鱼与尖头黄鳍牙（鱼或）近缘，而“鮸状黄姑鱼”则与
眼斑拟石首鱼、有名锤形石首鱼及犬牙石首鱼相邻；中国南海和印度洋的双棘原黄姑鱼或为不同属；支持将“鮸状黄姑鱼”与双棘原黄姑鱼从黄姑鱼属中独立出来的分类处理。
截尾白姑鱼与白姑鱼在系统树上处于相邻位置，但种间遗传距离较大，属的单系性尚待验证。浅色黄姑鱼、白姑鱼不同地理种群间均出现较大分化。
3．牙（鱼或）亚科黄鳍牙（鱼或）与中国产双棘原黄姑鱼近缘，而不与牙（鱼或）属聚类。银牙（鱼或）与红牙（鱼或）种间遗传距离小，或为种内差异；二者与居氏牙（鱼或）遗传距离较大，表明太平洋的种类与印度洋的种类分化较早。
4．黄鱼属与梅童鱼属属间遗传距离与本科多数属内种间遗传距离相当，且同属种均未能形成明显单系，或有归并为1属的可能；鮸鱼属与梅童鱼属-黄鱼属位于分子系统树的相邻位置，或支持3属组成黄鱼亚科的传统分类处理；不过该分支自展数据支持不高，该结论尚需进一步的验证。
棘头梅童鱼不同地理种群有较大分化。
5．Dendrophysarusselii与
石首鱼科各类群的亲缘关系均较远，其准确系统位置尚需进一步研究。石首鱼科初步的
分子系统学研究结果表明石首鱼科各等级分类群的划分均可能存在问题。解决石首鱼科的系统发育问题，需要更为广泛取样，并采用更多分子标记。
①大黄鱼，体近长方形而侧扁，背缘及腹缘的前方隆凸而后方为低。体长约30余厘米。头大而侧扁，吻圆钝。眼中等大，侧上位；眼间隔宽而稍隆凸。鼻孔每侧2个，前鼻孔圆而小，后鼻孔长形，较大，接近于眼。口前位，宽阔而斜。上、下颌相等，唇薄；上颌骨能伸缩。前鳃盖骨边缘有细锯齿，鳃盖骨后端有一扁棘。鳃孔大，鳃盖膜不与峡部相连。鳃耙较长。鳞片栉状，侧浅鳞57；侧线下鳞较侧线上鳞为大。背鳍及臀鳍的鳍条部2/3以上均蒙小圆鳞。侧线前部较弯曲，后部较直。背鳍Ⅷ～Ⅹ31，起点在胸鳍起点的上方。臀鳍Ⅱ9，起点约与背鳍鳍条的中部相对，胸鳍15，起点在鳃盖后。腹鳍小于胸鳍。尾鳍楔形。体背侧灰黄色，下侧金黄色；背鳍及尾鳍灰黄色，胸鳍、腹鳍及臀鳍为黄色。 多活动于海水中下层，有洄游习性。 ②小黄鱼，形状和大黄鱼相近而小。体长约20厘米。侧线鳞60～63。背鳍Ⅸ34～36，起点与胸鳍的起点相对。臀鳍Ⅱ9，起点稍后于背鳍鳍条的中部。胸鳍19，长而尖，末端超过腹鳍的末端。腹鳍稍短于胸鳍。尾鳍楔形。体背侧灰褐色，两侧及腹侧为黄色，背鳍边缘灰褐色。有洄游习性。